1. 如何查找基因之間相互作用的資料庫
基因間的相互作用又稱上位性或基因間互作,考慮兩個基因位點A-a和B-b,上位性有四種類型,即純合基因型間的上位性、A位點純合基因型和B位點雜合基因型間的上位性(用ad表示)、A位點雜合基因型和B位點純合基因型間的上位性(用da表示)以及雜合基因型間的上位性(用dd表示).
從代謝系統或基因的調控角度就比較好理解這個問題:任何基因的表達都需要一個表達系統,系統間的因子之間都存在著相互的作用。上游或下游因子的表達與否,劑量都會對當前基因有一定的反饋調控作用。
2. 中國DNA資料庫建立了嗎
中國DNA資料庫建立了。
中國國內的,在偵破案件上使用DNA技術,是很早就有的,但是真正的DNA系統是最近10年間才發展起來的。中國國內的DNA資料庫系統,有數據量大,增長量快,比對復雜等特點。
目前主流公安機關使用的DNA系統 ,是由北京海鑫高科技有限公司和遼寧省公安廳刑事科學研究所共同研究的項目。該項目也列入了國家」十五「科技課題和公安廳的」金盾計劃「。
針對近幾年拐賣兒童案件逐年上升的趨勢,公安部又組織開發建立了全國公安機關「打拐」DNA資料庫,使許多被拐賣的孩子和家裡親人得以團聚。
(2)基因資料庫擴展閱讀:
中國DNA資料庫始建於新世紀初,國家九五科技攻關項目法庭科學DNA資料庫建設關鍵技術、國產化DNA試劑的研製等項目相繼執行,標志著我國DNA資料庫建設啟動,而在公安機關打拐專項行動中建立全國打拐DNA資料庫並實現異地查詢,則標志著我國DNA資料庫進入建設實施階段。
至2010年12月,全國公安機關共建立了312個DNA實驗室,其中283個與國家庫聯網,DNA數據總量達700餘萬份,居世界第2位,日均破案150餘起。
參考資料來源:網路-DNA資料庫
參考資料來源:網路-DNA資料庫
3. ncbi基因組資料庫包括了哪些文件
NCBI對BLAST進行了全新的改版,推出了最新的web BLAST report。在最新的BLAST比對結果頁面中,「圖形化概要(Graphic Summary)」、「具體描述(Descriptions)」以及「序列比對(Alignments)」等部分頁面都可以展開和收起。此外,網頁上還提供了「結果輸出格式選項(Formatting)」和「結果下載選項(download)」,在下載選項中還新增了CSV格式下載。這樣,讀者可以輕松地將BLAST的比對結果輸入到表格處理軟體中去。另外,BLAST比對結果頁面上的「Alignments」部分還提供了每一條命中序列在Entrez Gene中的相關信息,這些信息包括基因名稱、來源物種以及在PubMed資料庫中與該基因有關條目的數目等。
4. 存儲基因數據,一般用什麼資料庫
基金數據可以使用mysql,sqlserver等關系型資料庫
這種資料庫存儲效率高, 增刪改查比較方便
5. 如何在網上查找一個疾病的所有相關基因
全基因組關聯研究(GWAS)發現了數百種與復雜人類疾病相關的基因突變,但這些突變大部分對增加患病風險的貢獻都非常小。遺傳性似乎有一大部分無法被檢測到。人們對遺傳性中未能檢測到的這一部分提出以下可能的解釋:影響較小的大量變異體尚未發現;存在一些當前的基因型分析技術無法檢測到的罕見的結構變異或表觀遺傳變異;以及存在難以檢測到的基因與基因之間和基因與環境之間的相互作用。
在一篇「Review」文章中,Teri Manolio及其同事對最有可能將這些解釋和其他可能的解釋加以區分的研究策略進行了分析。
Finding the missing heritability of complex diseases
Teri A. Manolio1, Francis S. Collins2, Nancy J. Cox3, David B. Goldstein4, Lucia A. Hindorff5, David J. Hunter6, Mark I. McCarthy7, Erin M. Ramos5, Lon R. Cardon8, Aravinda Chakravarti9, Judy H. Cho10, Alan E. Guttmacher1, Augustine Kong11, Leonid Kruglyak12, Elaine Mardis13, Charles N. Rotimi14, Montgomery Slatkin15, David Valle9, Alice S. Whittemore16, Michael Boehnke17, Andrew G. Clark18, Evan E. Eichler19, Greg Gibson20, Jonathan L. Haines21, Trudy F. C. Mackay22, Steven A. McCarroll23 & Peter M. Visscher24
Genome-wide association studies have identified hundreds of genetic variants associated with complex human diseases and traits, and have provided valuable insights into their genetic architecture. Most variants identified so far confer relatively small increments in risk, and explain only a small proportion of familial clustering, leading many to question how the remaining, 'missing' heritability can be explained. Here we examine potential sources of missing heritability and propose research strategies, including and extending beyond current genome-wide association approaches, to illuminate the genetics of complex diseases and enhance its potential to enable effective disease prevention or treatment.
6. DNA資料庫的EMBL
歐洲生物信息學研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)創建的一個核酸序列資料庫。EMBL的數據來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構通過計算機網路直接提交,另一部分則來自科技文獻或專利(Stoesser等, 1998)。EMBL與DDBJ、GenBank建有合作關系,他們分別在全世界范圍內收集核酸序列信息,每天都將新發現或更新過的數據相互交換。
DNA資料庫的規模正在以指數方式增長,平均不到9個月就增加一倍。1998年1月,EMBL中收錄的序列數已超過一百萬,包括15,500個物種,其中模式生物的序列佔50%以上,它們包括人類(Homo sapiens), 線蟲(Caenorhabditis elegans),啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),小鼠(Mus musculus)和擬南芥(Arabidopsis thalania)。
可以利用序列查詢系統 SRS(Sequence Retrieval System)從EMBL資料庫中提取有關信息(Etzold等,1996年)。SRS序列查詢系統通過超文本鏈接將DNA序列資料庫和蛋白質序列、功能位點、結構、基因圖譜以及文獻摘要MEDLINE等各種資料庫聯系在一起。利用EBI網站提供的BLAST或FastA程序,可以對EMBL資料庫進行未知序列同源性搜索。
7. 如何給孩子上dna資料庫
這種資料庫一般人是不會用到的。只有國家和有關部門機構還會有的吧。它會幫你記錄孩子的信息。基因和基因組的資料
8. 人的基因資料庫和指紋資料庫有哪些不同
人類手指上的皮膚和身體的皮膚有很大不同。其一,手指皮膚有凸紋,沒有毛發,不會有油脂,但卻有很多汗孔;其二,指紋具有唯一性和穩定性,隨著年齡的增長指紋上雖然會起皺,但是圖案基本不變;其三,人手接觸各種物體表面通常會留下痕跡。這些特性就使得指紋特別適合做身份識別,也即我們所說的「指紋識別」。
美國夏威夷大學癌症研究中心研究發現:女性左手指箕形紋如果開口向右的紋形較多,患乳癌的機會可能較高。英國學者的研究證實:斗紋越多,越容易患高血壓。美國紐約大學的研究發現:老年痴呆病人組中,十指中有8個指頭為小指側箕型的人佔72%,而對照組中只有26%;病人組中有14人的十指全部為小指側箕型指紋,而對照組中只有4人。專家同時說,這僅是統計學的調查資料,並不意味著凡是十指中有8個指頭是小指側箕型紋的人,都一定會患上老年性痴呆症。
9. 求基因表達常用資料庫
IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003轉錄本。
ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID,OTTHUMT00000090763是另一個資料庫對同一轉錄本的編號(Havana transcript)。
http://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?db=core;g=ENSG00000067704;r=1:220267444-220321380;t=ENST00000490891
UCSC Microarray Expression Data 給出了基因mRNA在人類不同組織中的表達量
http://genome.ucsc.e/cgi-bin/hgGene?hgg_gene=uc001hmc.2&hgg_prot=B2RPG8&hgg_chrom=chr1&hgg_start=220267454&hgg_end=220321376&hgg_type=knownGene&db=hg19&hgsid=193781719
GEO資料庫給出了詳細的基因mRNA在不同組織中的表達數據,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
基因的表達量不等於轉錄本的表達量,特定轉錄本IARS2-003的表達量需要自行實驗證明。
10. 基因資料庫 一般使用什麼資料庫
集合所有已知核酸的核苷酸序列,單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述,包括它們的科學命名、來源物種分類名稱、參考文獻等信息的資料庫。基因和基因組的資料也包含在DNA資料庫中。目前國際上比較重要的核酸(含蛋白質)一級資料庫有美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個資料庫信息共享,每日交換,故資料是一樣的,唯格式有所不同。