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比較基因組雜交晶元及技術服務
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人類HD-CGH晶元 (60-mer, 44K×4 \ 105K×2 \ 244K)，小鼠(60-mer, 44K×4)，任意物種定製HD-CGH (8×15K, 4×44K, 2×105K, 244K)等等。
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Ⅲ 小麥正常雄蕊變雌蕊是基因突變嗎
來自知網
作者
唐海峰
摘要
HTS-1是一種新型的小麥雄蕊同源轉化為雌蕊突變體,與普通小麥不同的是它的雄蕊部分或者全部同源轉化為雌蕊,甚至我們可以在HTS-1中發現沒有雄蕊但出現6個雌蕊或者6個雌蕊化結構的小花。因此HTS-1在研究小麥育種和花發育中具有很重要的...
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關鍵詞
小麥；基因分型測序(GBS)；雄蕊同源轉化為雌蕊突變體；Win基因
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知網
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Ⅳ 基因晶元技術的基本原理
基因晶元又稱DNA晶元(DNA chip )或DNA微陣列(DNA microarray)。其原理是採用光導原位合成或顯微印刷等方法將大量特定序列的探針分子密集、有序地固定於經過相應處理的矽片、玻片、硝酸纖維素膜等載體上,然後加入標記的待測樣品,進行多元雜交,通過雜交信號的強弱及分布,來分析目的分子的有無、數量及序列,從而獲老者敏得受檢樣品的遺傳信息。其工作原理與經典的核酸分子雜交如Southern和Northern印跡雜交一致,都是應用已知核酸序列與互補的靶序列雜交,根據雜交信號進行定性與定量分析。經典雜交方法固定的是靶序列,而基因晶元技術固定的是已知探針,因此基因晶元可被理解為一種反向雜交。基因晶元能夠同時平行分析數萬個基因,進行高通量篩選與檢測分析,解決了傳統核酸印跡雜交技術操作復雜、自動化程度低、檢測目的分子數量少等不足。根據所用探針類型,基因晶元可分為cDNA ( comp lement DNA)晶元和寡核苷酸晶元;根據檢測目的又可分為表達譜晶元和單核苷酸多態性( single nucleotide polymorphisms, SNP)晶元。隨著晶元技術在其他生命科學領域的延伸,基因晶元概念已泛化到生物晶元,包括基因晶元、蛋白質晶元、糖晶元、細胞晶元、流式晶元、組織晶元和晶元實驗嫌差室( laboratory on a chip)等。
晶元基片可用材料有玻片、矽片、瓷片、聚丙烯膜、硝酸纖維素膜和尼龍膜,其中以玻片最為常用。為保證探針穩定固定於載體表面,需要對載體表面進行多聚賴氨酸修飾、醛基修飾、氨基修飾、巰基修飾、瓊脂糖包被或丙烯醯胺硅烷化,使載體形成具有生物特異性的親和表面。最後將制備好的探針固定到活化基片上,目前有兩種方法:原位合成和合成後微點樣。根據晶元所使用的標記物不同,相應信號檢測方法有放射性核素法、生物素法和熒光染料法,在以玻片為載體的晶元上目前普遍採用熒光法。相應熒光檢測裝置有激光共聚焦顯微鏡、電荷偶合器( charge coup led devices, CCD)、激光掃描熒光顯微鏡和激光共聚焦掃描儀等。其中的激光共聚焦掃描儀已發展為基因晶元的配套檢測系統。經過晶元掃描提取雜交信號之後,在數據分析之前,首先要扣除背景信號,進行數據檢查、標化和校正,消除不同實驗系統的誤差。對於簡單的檢測或科學實驗,因所需分析基因數量少,故直接觀察即可得出結論。若涉及大量基因尤其是進行表達譜分析時,就需要藉助專門的分析軟體,運用統計學和生物信息學知識進行深入、系統的分析,如主成分分析、分層聚類分析、判別分析和調控網路分析等。晶元數據分析結束並不表示晶元實驗的完成,由於基因晶元獲取的信息量大,要對呈數量級增長的實驗數據進行有效侍枝管理,需要建立起通行的數據儲存和交流平台,將各實驗室獲得的實驗結果集中起來形成共享的基因晶元資料庫,以便於數據的交流及結果的評估。
Ⅳ 小麥基因晶元 90k k代表什麼意思
k代表1000. 90k意思是90000個探針。
Ⅵ 生信如何在資料庫中篩選某個基因低表達的患者
生信中可以通過在公共資料庫中進行數據挖掘來篩選出某個基因低表達患者的信息。具體步驟如下：
1. 選擇公共資料庫：如NCBI、ENSEMBL等。
2. 輸入關鍵詞：通過輸入關鍵詞，如基因名、疾病名等來查找相關的數據。
3. 篩選條件：在搜索結果頁面中，可以根據需要選擇篩選條件，如樣本類型、實驗方法、表達量等。
4. 分析結果：根據篩選條件得到一批樣本，可以進行數據分析，如表達譜分析、差異分渣碰析等。
5. 確定差異表達如段談基因：通過數據分析得到差異表達基因，確定低表達的患者。
原因：生物信息學是通過計算機方法來處理與生物學相關的數據燃答，因此可以通過在公共資料庫中進行數據挖掘，來篩選出某個基因低表達的患者。在生信研究中，這種方法被廣泛運用，可以對基因表達進行深入的研究，為疾病的預防、診斷和治療提供參考依據。
拓展：除了在公共資料庫中進行數據挖掘，還可以使用一些生信工具來篩選差異表達基因，如DESeq2、edgeR等。這些工具可以幫助研究人員進行高通量數據的分析和解讀，從而更准確地發現差異表達基因，為疾病的研究提供更全面的信息。