『壹』 1.求推薦一家靠譜的尿液代謝組學和血清代謝組學服務公司
(1) 尿液樣品採集需要馬上進行萃滅:快速使組織或細胞內的酶失活,防止代謝物的變化。液氮速凍是常用的萃滅方式。尿液採集後需立即放入-80℃或液氮保存。在NMR分析中,建議用0.2um濾膜過濾除菌。GC-MS分析中,由於尿素高溫分解產生的氨氣可能對檢測其他物質造成干擾,因此分析前應加入尿素酶除去尿素。樣本量要求200µL/例。LC-MS分析對樣品則要求較少,僅需要棄去沉澱凍存即可。
(2)血液樣品:包括血漿和血清,血清中代謝物的含量略高於血漿,血清和血漿均可用於代謝組學研究,但是取樣盡量一致,要麼都用血清,要麼都用血漿。
血漿樣品:應使用肝素鈉抗凝管(EDTA等其餘抗凝劑會對質譜信號有影響)採集全血,並盡快進行血漿分離:3000 rpm室溫離心10 min,待血細胞完全沉降到管底後,取上層,0.2 mL/管分裝至1.5 mL離心管中。-80°C凍存,乾冰寄送。樣本量要求100-200µL/例。
血清樣品:血液收集在離心管中37°C(或室溫)靜置30 min或1 h進行凝固分層;3000 rpm室溫離心10 min,待血細胞完全沉降到管底後,取上清轉至干凈的離心管中; 再12000 rpm 4°C離心10 min,取上清分裝到1.5 mL離心管中,每管0.2 mL,-80 °C凍存,乾冰寄送。樣本量要求100-200µL/例。
現在市面上提供代謝組學的公司基本上都是基於LC-MS, GC-MS, NMR這三種技術展開。NMR技術的優點是樣品可回收利用,但對復雜樣品:例如血液樣品的代謝組學分析,稍顯力不從心,基於NMR的代謝組學資料庫還沒有大型的可參考標准物質譜圖,這就使得解析譜圖異常困難,遇到多物質的譜圖重疊等問題很難解決。GC-MS由於需要樣品衍生化,會有一部分物質丟失,並且由於精密度等原因,所測得的物質較少,並不能完整的反應該時刻的代謝輪廓特徵。由於高分辨質譜的發展,配備有高分辨檢測器的LC-MS例如LC-TOF-MS越來越成為了代謝組學樣品分析的有利武器。並且隨著MASSBANK, METLIN,HMDB等資料庫的完善,使得LC-MS的數據的物質鑒定效率大大提升。不光如此,在樣品的前處理中,使用LC-MS技術所需的處理步驟最為簡單,可以很大程度上減少代謝物的流失。因此高分辨LC-MS技術已成為代謝組學中的主流手段被廣泛使用。
目前國內做代謝組學的單位有很多,價格不一。如果是華北地區,可以考慮百泰派克,這家公司的價格很合理技術也挺好。
注意事項:建議盡量多的收集樣本並分裝凍存,100-200µL/管較為合適,且避免反復凍融。