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pdb資料庫軟體

發布時間: 2022-04-22 04:56:23

『壹』 請問PDB資料庫文件如何打開

1、打開vs2015,在菜單欄上找到「工具」---》「選項」。

『貳』 PDB資料庫網址是什麼

http://www.uniprot.org/
新的「聯合蛋白質資料庫」預計在三年內建成,美國國家衛生研究所已決定為這項計劃斥資1500萬美元。這一全球性資料庫有望在2003年年底初步在網際網路上開放,各國研究人
員可通過訪問其網址www.uniprot.org,免費獲取信息。(新浪網 2002年11月01日)
蛋白質資料庫(Protein Data Bank, PDB)是一個生物大分子,如蛋白質和核酸,的資料庫。這些數據包括X光晶體衍射或者NMR核磁共振顯示以及由全世界生物學家和生物化學家上傳,在網上,它們可以通過PBD的會員組織(PDBe, PDBj, RCSB)免費獲取。PDB是由一個叫做世界蛋白質資料庫(Worldwide Protein Data Bank, wwPDB)管理。PDB是結構生物(如結構基因組學)的一個關鍵性資源。大部分學術刊物,以及一些官方科研機構[如美國的國立衛生研究院(NIH)],現在都要求科學家將它們研究的蛋白質、核酸結構上傳到PDB
從PDB的網站上,可以通過蛋白質的編號查找到相應的3D結構,並可以將這個結構圖下載到電腦中,通過PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等軟體查看、編輯。 從PDB網站上下載的3D結構圖的後綴名為.pdb。

『叄』 oracle pdb資料庫怎麼打開

PDB全稱為Pluggable Database,即可插拔資料庫。
打開PDB資料庫的方法有兩種:
方式1:
SQL> alter pluggable database PDBEPPS open;

Pluggable database altered.

SQL> select con_id, dbid, guid, name , open_mode from v$pdbs;

CON_ID DBID GUID NAME OPEN_MODE

---------- ---------- -------------------------------- ------------------------------ ----------

2 4071321146 PDB$SEED READ ONLY

3 1930201447 PDBEPPS READ WRITE

方式2:
SQL> alter session set container=PDBEPPS;

Session altered.

SQL> startup

Pluggable Database opened.

『肆』 誰知道VC產生的程序資料庫 (PDB) 文件有什麼用什麼時候用怎麼用

使用
/Zi
選項編譯的對象
(.obj)
文件包含程序資料庫
(PDB)
的名稱。不將對象的
PDB
文件名指定給鏈接器;如果需要,LINK
使用嵌入的名稱查找
PDB。這同樣適用於庫中包含的可調試對象;可調試庫的
PDB
必須可用於鏈接器和該庫。
LINK
還使用
PDB
保存
.exe
文件或
.dll
文件的調試信息。程序的
PDB
既是輸出文件也是輸入文件,因為
LINK
在重新生成程序時更新
PDB。

『伍』 pdb的數據

蛋白質資料庫(Protein Data Bank,PDB) 是一個生物大分子(如蛋白質和核酸)資料庫, 內容包括由全世界生物學家和生物化學家上傳的蛋白質或核酸的X光晶體衍射或者NMR核磁共振結構數據,這些數據可以通過PBD的會員組織(PDBe,PDBj,RCSB)免費獲取。PDB是由世界蛋白質資料庫(Worldwide Protein Data Bank,wwPDB)管理。PDB是結構生物學的關鍵性資源,大部分學術刊物,以及一些官方科研機構[如美國的國立衛生研究院(NIH)],現在都要求科學家將它們研究的蛋白質、核酸結構上傳到PDB。
從PDB的網站上,可以通過蛋白質的編號查找到相應的3D結構,並可以將這個結構圖下載到電腦中,通過PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等軟體查看、編輯。
從PDB網站上下載的3D結構圖的後綴名為.pdb。

『陸』 oracle pdb和cdb的區別

區別一:包含關系不同

1、PDB全稱為Pluggable Database,即可插拔資料庫

2、CDB全稱為Container Database,中文翻譯為資料庫容器,一個資料庫容器(CDB)承載多個可插拔資料庫(PDB)

區別二:用戶使用時存放位置不同

1、COMMON USERS(普通用戶):經常建立在CDB層,用戶名以C##或c##開頭;

2、LOCAL USERS(本地用戶):僅建立在PDB層,建立的時候得指定CONTAINER。


(6)pdb資料庫軟體擴展閱讀

CDB組件(Components of a CDB)

ROOT組件

ROOT又叫CDB$ROOT, 存儲著ORACLE提供的元數據和Common User,元數據的一個例子是ORACLE提供的PL/SQL包的源代碼,Common User 是指在每個容器中都存在的用戶。

SEED組件

Seed又叫PDB$SEED,這個是你創建PDBS資料庫的模板,你不能在Seed中添加或修改一個對象。一個CDB中有且只能有一個Seed. 這個感念,個人感覺非常類似SQL SERVER中的model資料庫。

PDBS

CDB中可以有一個或多個PDBS,PDBS向後兼容,可以像以前在資料庫中那樣操作PDBS,這里指大多數常規操作。

這些組件中的每一個都可以被稱為一個容器。因此,ROOT(根)是一個容器,Seed(種子)是一個容器,每個PDB是一個容器。每個容器在CDB中都有一個獨一無二的的ID和名稱。

『柒』 如何搜索PDB資料庫

PDB是Palm DataBase的縮寫,Palm OS所用文件的擴展名為.pdb。可以使用PalmReader打開。 如果想把PDB文件轉換成TXT文件查看,可以使用WavePDB轉。
程序資料庫 (PDB) 文件保存著調試和項目狀態信息,使用這些信息可以對程序的調試配置進行增量鏈接。常見的VC80.PDB(更籠統地說就是 VCx0.PDB,其中 x 表示 Visual C++ 的版本。) 該文件存儲各個 OBJ 文件的所有調試信息並與項目生成文件駐留在同一個目錄中。

『捌』 怎麼篩選PDB資料庫中的蛋白

打開PDB資料庫輸入你知道的PDB編號 如果不知道編號就輸入英文名稱或者簡稱,搜索後出現蛋白質列表 一個個看 看哪個是你想要的.點一下,右上方有下載鏈接.下載xxx.pdb到本地磁碟後 用pymol或者rasmol軟體打開看.或者用文本編輯器打開看詳細的附加信息.