㈠ 怎樣根據pdb序列號找目的基因
1.文本打開晶體結構文件,把所有殘基一個一個的拷貝下來,並改成單字母表示,就ok了。
2.在www.pdb.org里,找到你的晶體結構,Molecular Description下UniProtKB行的最後一個字元串是序列代碼,點擊進去就有一級序列了。
㈡ 我想從蛋白質的pdb文件中批量提取出序列的信息,怎麼搞
你是想把蛋白的序列提取出來是嗎,可以用perl寫個腳本,先一個一個的打開pdb文件,然後讀出以SEQRES開頭的行,並寫入到一個新的文件中。
㈢ 後綴為pdb的文件能刪除么
PDB文件是Palm OS操作系統上數據文件類型。一般我們在使用Palm系統的電子書時都會遇到這種文件,一般用於電子書或手機電子書 pdb是Palm DataBase的縮寫,Palm OS所用文件的擴展名為.pdb。
project.PDB 該文件存儲 .exe 文件的所有調試信息。還是不要隨意刪除~~~
㈣ 磁碟里自動生成了一堆pdb文件,簡單來說它是幹嘛的,我可以轉移或者刪掉嗎
PDB文件是在我們編譯工程的時候產生的,它是和對應的模塊(exe或dll)一起生成出來的。
一般可能不會意識到PDB文件的重要性,因為如果只是我們本地進行開發,總是能夠進行調適。
這里我要引入兩個概念:Private Build和Public Build。
Private Build指的是在開發機器上的編譯,Public Build指的是在負責編譯的機器上的編譯。
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㈤ 誤刪PDB的文件後如何刪除PDB
場景:同事誤刪了PDB的文件,我們查看v$datafile,仍然存有刪過的數據文件信息;此時cdb也起不來,所有pdb也都是mounted狀態。直接刪pdb的話會報錯。
需要按如下方式刪除pdb:
1.進入pdb中:
2.將誤刪的文件offline+drop
3.切換到cdb,刪除pdb1並啟動cdb
㈥ 怎樣用pdb 做抗原抗體表位分析
如何利用生物學對蛋白的的抗原表位進行分析
蛋白晶元技術的研究對象是蛋白質,其原理是對固相載體進行特殊的化學處理,再將已知的蛋白分子產物固定其上(如酶、抗原、抗體、受體、配體、細胞因子等),根據這些生物分子的特性,捕獲能與之特異性結合的待測蛋白(存在於血清、血漿、淋巴、間質液、尿液、滲出液、細胞溶解液、分泌液等),經洗滌、純化,再進行確認和生化分析;它為獲得重要生命信息(如未知蛋白組分、序列。體內表達水平生物學功能、與其他分子的相互調控關系、物篩選、物靶位的選擇等)提供有力的技術支持。
固體晶元的構建
常用的材質有玻片、硅、雲母及各種膜片等。理想的載體表面是滲透濾膜(如硝酸纖維素膜)或包被了不同試劑(如多聚賴氨酸)的載玻片。外形可製成各種不同的形狀。Lin,SR等人引採用APTS-BS3技術增強晶元與蛋白質的結合。
探針的制備
低密度蛋白質晶元的探針包括特定的抗原、抗體、酶、吸水或疏水物質、結合某些陽離子或陰離子的化學集團、受體和免疫復合物等具有生物活性的蛋白質。制備時常常採用直接點樣法,以避免蛋白質的空間結構改變。保持它和樣品的特異性結合能力。高密度蛋白質晶元一般為基因表達產物,如一個cDNA文庫所產生的幾乎所有蛋白質均排:列在一個載體表面 ,其芯池數目高達1600個/cm2,呈微距陣排列,點樣時須用機械手進行,可同時檢測數千個樣品。
㈦ .net里Release的pdb文件有什麼用 是否可以刪除
程序資料庫 (PDB) 文件保存著調試和項目狀態信息,使用這些信息可以對程序的調試配置進行增量鏈接。 在使用 /debug 生成時,會創建一個 PDB 文件。 可以使用 /debug:full 或 /debug:pdbonly 生成應用程序。 使用 /debug:full 生成將產生可調試的代碼。 使用 /debug:pdbonly 生成將產生 PDB,但是不會產生通知 JIT 編譯器調試信息可用的 DebuggableAttribute。 如果您想為不希望其成為可調試的發布版本生成 PDB,請使用 /debug:pdbonly。 有關更多信息,請參見 /debug (C# 編譯器選項)或 /debug (Visual Basic)。
Visual Studio 調試器使用 EXE 或 DLL 文件中的 PDB 路徑查找 project.pdb 文件。 如果調試器無法在該位置找到 PDB 文件,或者該路徑無效,調試器將先搜索包含 EXE 的路徑,然後搜索「選項」對話框中指定的符號路徑。 該路徑通常是「符號」節點中的「調試」文件夾。 如果調試器無法找到 .PDB 文件,則顯示「查找符號」對話框,這將允許您搜索符號或向搜索路徑添加其他位置。
Debug里的PDB是full,保存著調試和項目狀態信息、有斷言、堆棧檢查等代碼。
Release 里的PDB是pdb-only,基本上:出什麼錯了+錯誤在哪行。因為很多人把PDB理解成:調試文件、Program Debug Database、會泄露代碼機密,所以想將其刪除,那隻要在VS的 項目-->生成-->高級-->調試信息-->None便可重要事項調試器只會為二進制文件載入與該二進制文件生成之時所創建的 PDB 完全相符的 PDB。 就是說,該 PDB 必須是原 PDB 或其副本。 因為編譯器在創建二進制文件時會考慮多種因素,所以,即使代碼自身沒有變化,二進制文件的實際布局也可能會有變化。
㈧ VC鏈接問題:如何減小PDB文件
你最好在頭文件中用上
#ifndef _xxx_
#define _xxx_
//你頭文件中的內容
#endif
pdb太大隻能說明你過多鏈接頭文件了
㈨ bat命令:怎樣刪除當前目錄和子目錄下所有*.pdb文件
del /s *.pdb
另存為Bat,即可刪除當前目錄 以及子目錄下的Pdb文件