① 已知氨基酸序列,人工合成基因,在特定受體細胞中表達,如何挑選密碼子(重點:包含偏好性的問題)
首先確定目的細胞的密碼子偏好。盡量用最優密碼子進行反向翻譯。之後,確認你的目的片段不含會使用的酶切位點。若含有,則用第二順位偏好的密碼子同義突變它。第三,確保你的序列不會出現一定長度的重復序列。若出現,按照密碼子偏好順位同義突變它。按照這些標准就可以去提交訂單了。如果對編程語言有所掌握,可以編寫一個簡單的程序完成上述工序。
我以前這樣合成過基因,表達情況還不錯~
② 密碼子的特點有哪些
1)每個密碼子三聯體(triplet)決定一種氨基酸;
2)兩種密碼子之間無任何核苷酸或其它成分加以分離,即密碼子無逗號;
3)密碼子具有方向性,例如AUC是Ile的密碼子,A為5"端鹼基,C為3"端鹼基。因此密碼也具有方向性,即mRNA從5"端到3"端的核苷酸排列順序就決定了多肽鏈中從N端到C端的氨基酸排列順序;
4)密碼子有簡並性(degeneracy)一種氨基酸有幾個密碼子,或者幾個密碼子代表一種氨基酸的現象稱為密碼子的簡並性。除了Met和Trp只有一個密碼子外,其它氨基酸均有二個以上密碼子,例如Arg有6個密碼子。
5)共有64個密碼子,其中AUG不僅是Met或者fMet(在原核細胞)的密碼子,也是肽鏈合成的起始信號,故稱AUG為起始密碼子。UAA、UAG和UGA為終止密碼子,不代表任何氨基酸,也稱為無意義密碼子。
6)密碼子有通用性,即不論是病毒、原核生物還是真核生物密碼子的含義都是相同的。但真核細胞線粒體mRNA中的密碼子與胞漿中mRNA的密碼子有以下三點不同:一是線粒體中UGA不代表終止密碼子,而是編碼Trp;二是肽鏈內的Mer由AUG和AUA二個密碼子編碼,起始部位的Met由AUG、AUA、AUU和AGG均為密碼;三是AGA和AGG不是Arg的密碼子,而是終止密碼子,即UAA、UAG、AGA和AGG均為終止密碼子。
③ 人教版高中生物必修二當中什麼是起始密碼子什麼是終止密碼子它們的概念分別是什麼它們有什麼作用
起始密碼子 initiation codon mRNA上的鹼基順序每3個鹼基用解讀框架劃分開,可決定其所生成蛋白質的氨基酸順序,為了使鹼基順序作為遺傳信息能正確轉譯,通常需要從某個特定的位置開始轉譯。這個起始點的密碼子就叫做起始密碼子
終止密碼子
1.蛋白質翻譯過程中終止肽鏈合成的信使核糖核酸(mRNA)的三聯體鹼基序列。2.mRNA翻譯過程中,起蛋白質合成終止信號作用的密碼子。3.mRNA分子中終止蛋白質合成的密碼子。