1. 誰用過NCBI的CDD資料庫
NCBI的產生和發展是在美國和全球生物學高速發展,高通量數據急速產生,而缺乏有效的數據分析方法的背景下產生,起初它主要任務是數據的存儲和查詢。只不過其存儲的數據大多以高通量數據為主,例如基因測序,基因組,SNP, 基因晶元,小分子化合物和GWAS數據等。這些數據的共享,極大地促進了生物信息學發展。
按照數據->樣式->知識->智慧的發展模式,NCBI主要起到了一個為生物學家提供數據的角色。不過,NCBI目前也不斷地在調整自己的角色。例如,生物醫學文獻。NCBI在從NLM繼承過來的pubmed的基礎,提供以PMC資料庫為核心的全文文獻服務。PubMed資料庫應該是全球生物學家使用頻率最高的資料庫。NCBI最近對pubmed的改版,雖然沒有實質性的改變,但其按照用戶體驗進行的修改,足見其對該資料庫的重視。
另外,NCBI目前不斷地在引入高學歷生物學人才對其資料庫的質量進行控制。以dbSNP為例,其正在通過與領域專家的合作將突變數據與人類表型數據進行關聯。
總得來講,NCBI的發展是與生物學高通量數據產生密切相關,它以經不在局限於提供數據存儲與查詢,其未來的發展必將發展為一個大型的、綜合的知識庫。到那時NCBI會不會免費,就要另當別論了。很顯然沒有人會將自己的手稿拱手讓人。如果真有那麼一天,不知道從中會產生多少專利和知識產權。
2. 中科聲龍有哪些技術優勢
創新運用的3D-TSV堆疊技術,它能夠在提升晶元結構功能密度和縮短互連長度的同時,進一步提升產品的系統性能,降低整體功耗。英特爾INTEL,桌面/伺服器將復雜做到極致,ARM移動終端將功耗做到極致,英偉達NVIDIA矩陣計算將並行做到極致,中科聲龍可謂是把帶寬做到極致。
3. NCBI有多少資料庫,分別有什麼作用
在生物醫學信息學領域,資料庫和服務的定義與計算機領域有很大的不同,如果要問NCBI過去,現在或將來會有多少資料庫,恐怕連NCBI自己都說不清楚。要是一個一個資料庫講下來,9999個字肯定不夠用。這里有一個列表供您參考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/。
NCBI的產生和發展是在美國和全球生物學高速發展,高通量數據急速產生,而缺乏有效的數據分析方法的背景下產生,起初它主要任務是數據的存儲和查詢。只不過其存儲的數據大多以高通量數據為主,例如基因測序,基因組,SNP, 基因晶元,小分子化合物和GWAS數據等。這些數據的共享,極大地促進了生物信息學發展。
按照數據->樣式->知識->智慧的發展模式,NCBI主要起到了一個為生物學家提供數據的角色。不過,NCBI目前也不斷地在調整自己的角色。例如,生物醫學文獻。NCBI在從NLM繼承過來的pubmed的基礎,提供以PMC資料庫為核心的全文文獻服務。PubMed資料庫應該是全球生物學家使用頻率最高的資料庫。NCBI最近對pubmed的改版,雖然沒有實質性的改變,但其按照用戶體驗進行的修改,足見其對該資料庫的重視。
另外,NCBI目前不斷地在引入高學歷生物學人才對其資料庫的質量進行控制。以dbSNP為例,其正在通過與領域專家的合作將突變數據與人類表型數據進行關聯。
總得來講,NCBI的發展是與生物學高通量數據產生密切相關,它以經不在局限於提供數據存儲與查詢,其未來的發展必將發展為一個大型的、綜合的知識庫。到那時NCBI會不會免費,就要另當別論了。很顯然沒有人會將自己的手稿拱手讓人。如果真有那麼一天,不知道從中會產生多少專利和知識產權。
4. 第二代測序技術(NGS)是什麼,有什麼優勢
NGS又叫高通量測序,當傳統的癌症治療不起作用,或者醫生不能確定患者的癌症起源(原發灶)時,NGS(二代測序)可以幫助確定腫瘤中的基因突變,這些突變可能與某些針對特定變異的葯物相匹配。NGS主要優勢是通量大,可以得到海量的數據,高通量最小的數據量單位是G,而一代測序一次只能產生1K的數據。
NGS對晚期癌症患者的用處有多大,有研究表明:
1、在80.5%的患者中發現了潛在的可操作的基因組變異;
2、在接受測序指導治療的132名患者中,37.1%的患者取得了臨床獲益,19.7%的患者獲得了超級應答(定義為將他們的疾病控制至少一年);
3、對於原發灶不明癌患者,在近一半(50.9%)的病例中,NGS解決了組織溯源問題,為醫生提供更好的線索,了解哪些標准療法和靶向療法可能會有所幫助;
4、在15.8%的癌症患者中發現了潛在的可遺傳胚系致病變異(增加患癌風險),其中4.8%與靶向治療相關。
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5. 高通量DNA測序和基因組學新型技術的內容提要
三十年前,由Sanger和G訂bert分別建立了DNA雙脫氧測序和化學測序技術。現在DNA測序的規模逐漸擴大,從每天能讀幾千個鹼基對序列的小規模測序,發展到如
今每天能夠進行成千上萬個序列的精確測定,成為數十億美元的「產業」。世界上幾個大的測序中心建立了大規模的基因組測序平台,支持幾乎所有大學和大型醫院的DNA測序工作。國際生物信息學中心擁有存儲約一千五百萬鹼基對序列信息的能力,我們正處於一個「後基因組」時代。然而DNA測序在生命科學和醫學的許多領域,仍然是一個主要的診斷和研究手段。這種強勁的需求,推動了新的測序技術的發展。這些新技術既不用電泳,也不用Sanger測序方法,而是通過DNA合成的方法進行測序,包括在固相表面上進行的多重平行測序反應,每一個循環的數據通過成像的方法獲得。最近有一項由454生命科學和馬普研究所制定的計劃,使用合成法測序技術測定穴居人基因組,該計劃顯示了這些新的DNA測序技術在後基因組學研究中的強大作用。這將成為第二代全人類基因組項目,而且預計將進一步陝速提升我們對人類基因組生物學知識的認識,加深我們對人類遺傳性疾病機制的了解。
本書匯集了DNA測序技術的一些新的進展,全書的框架由一系列綜述組成,主要包括Sange,和SBS測序方法的進展(KumarandFuller)、毛細管電泳和微型集成系統
(XiongandCheng)、MS測序(Ehrichetal.)和應用(Mitchelsonetal.)。還包括了一些最新的進展,如SBS技術的新進展(Marguliesetal.)、核酸染料SBS測序方法(Edwardsetal.)、通過循環合成實現單分子測序(HebertandBrasiavsky)、納米孔測序(LeeandMeller),以及陣列DNA的游標測(Schwartzetal.)。在書的最後,討論了基因組拼接(Mc(;rath)中的生物信息學工具、古代和環境DNA樣品(Kowalchuketal.)的測序和SBS序列拼接工具(Keithetal.)等SBs測序的新應用。作者真誠希望此書的出版和發行能夠引起學生和研究人員對測序這個關鍵基因組學技術的興趣,並引發相關的技術革新。
6. zinc資料庫裡面有多少小分子
在生物醫學信息學領域,資料庫和服務的定義與計算機領域有很大的不同,如果要問NCBI過去,現在或將來會有多少資料庫,恐怕連NCBI自己都說不清楚.要是一個一個資料庫講下來,9999個字肯定不夠用.這里有一個列表供您參考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/.
NCBI的產生和發展是在美國和全球生物學高速發展,高通量數據急速產生,而缺乏有效的數據分析方法的背景下產生,起初它主要任務是數據的存儲和查詢.只不過其存儲的數據大多以高通量數據為主,例如基因測序,基因組,SNP,基因晶元,小分子化合物和GWAS數據等.這些數據的共享,極大地促進了生物信息學發展.
按照數據->樣式->知識->智慧的發展模式,NCBI主要起到了一個為生物學家提供數據的角色.不過,NCBI目前也不斷地在調整自己的角色.例如,生物醫學文獻.NCBI在從NLM繼承過來的pubmed的基礎,提供以PMC資料庫為核心的全文文獻服務.PubMed資料庫應該是全球生物學家使用頻率最高的資料庫.NCBI最近對pubmed的改版,雖然沒有實質性的改變,但其按照用戶體驗進行的修改,足見其對該資料庫的重視.
另外,NCBI目前不斷地在引入高學歷生物學人才對其資料庫的質量進行控制.以dbSNP為例,其正在通過與領域專家的合作將突變數據與人類表型數據進行關聯.
總得來講,NCBI的發展是與生物學高通量數據產生密切相關,它以經不在局限於提供數據存儲與查詢,其未來的發展必將發展為一個大型的、綜合的知識庫.到那時NCBI會不會免費,就要另當別論了.很顯然沒有人會將自己的手稿拱手讓人.如果真有那麼一天,不知道從中會產生多少專利和知識產權.
7. 談談基因測序技術經歷了哪幾個發展階段,這些技術的特點分別是什麼
基因測序也稱DNA測序,是現代生物學研究中重要的手段之一。基因測序技術經過了三個發展階段。第一代DNA測序技術是1975年由桑格(Sanger)和考爾森(Coulson)提出的鏈終止法。第一代技術准確率高,讀取長,是至今唯一可以進行「從頭至尾」測序的方法,但存在成本高、速度慢等方面的不足,並不是最理想的測序方法。使用第一代Sanger測序技術完成的人類基因組計劃,花費了30億美元巨資,用了十三年的時間。
隨後的二、三代測序技術以高通量為共同特徵,也被稱為「新一代測序技術(NGS)」。Roche公司的454測序平台、Illumina公司的Solexa測序系統以及ABI公司的SOLID測序系統標志著第二代測序技術誕生。盡管各系統在高通量水平、測序准確度、存儲格式、技術方法上各有差異,但共同特徵是大大降低了測序成本並極大地提高了測序速度,完成一個人的基因組測序只需一周左右時間。然而第二代測序技術在測序前要通過PCR段對待測片段進行擴增,增加了測序的錯誤率。而且二代測序產生的測序結果長度較短,需要對測序結果進行人工拼接,因此比較適合於對已知序列的基因組進行重新測序,而在對全新的基因組進行測序時還需要結合第一代測序技術。
近期出現的Helicos公司的Heliscope單分子測序儀、Pacific Biosciences公司的SMRT技術、Oxford Nanopore Technologies公司正在研究的納米孔單分子技術,被認為是第三代測序技術。與前兩代技術相比,其最大的特點是單分子測序。第三代測序技術解決了錯誤率的問題,通過增加熒光的信號強度及提高儀器的靈敏度等方法,使測序不再需要PCR擴增這個環節,實現了單分子測序並繼承了高通量測序的優點。更多基因相關資訊可登陸盛景基因查看。
8. 東南大學師生將校訓存入DNA序列,你如何看待這件事
東南大學師生將校訓存入DNA序列,你如何看待這件事?下面就我們來針對這個問題進行一番探討,希望這些內容能夠幫到有需要的朋友們。
歷史悠久,出身名門
東南大學成立於1902年,歷史悠久。1952年,中華人民共和國成立之初,原國立中央大學(南京大學)工程學院被納入復旦大學、交通大學、浙江大學、金陵大學等相關部門,並於1952年建立了相應的部門。東南大學於一九八八年更名。合並南京鐵路醫學院、南京交通大學、南京地質學院。
今天的東南大學,在某些標榜上,讓人更清楚地認識到自己的價值。中央直屬、985工程大學、211工程大學、雙一流建設大學、自主招生研究生等國家認可的專業類別。非營利性標志包括:建築老八校,四大學院之一。
9. 東南大學師生將校訓存入DNA序列,你是怎樣看待這件事的
東南大學生物科學與醫學工程學院、生物電子學國家重點實驗室劉宏教授團隊報道了集成化DNA存儲系統方面的研究進展,通過電極表面合成DNA分子及原位測序實現了單電極上數據寫入和讀取的一體化,為實現未來的高通量自動化DNA存儲系統打下基礎。相關成果以「Electrochemical DNA synthesis and sequencing on a single electrode with scalability for integrated data storage」為題在國際著名期刊Science Advances發表。
從東南大學的發展歷史、師資力量雄厚和取得的豐碩成果來看,東南大學實力非常強悍,它的通信、電子、建築、交通、生物醫學工程等在國內都是頂尖的。