1. 如何查找基因之间相互作用的数据库
基因间的相互作用又称上位性或基因间互作,考虑两个基因位点A-a和B-b,上位性有四种类型,即纯合基因型间的上位性、A位点纯合基因型和B位点杂合基因型间的上位性(用ad表示)、A位点杂合基因型和B位点纯合基因型间的上位性(用da表示)以及杂合基因型间的上位性(用dd表示).
从代谢系统或基因的调控角度就比较好理解这个问题:任何基因的表达都需要一个表达系统,系统间的因子之间都存在着相互的作用。上游或下游因子的表达与否,剂量都会对当前基因有一定的反馈调控作用。
2. 中国DNA数据库建立了吗
中国DNA数据库建立了。
中国国内的,在侦破案件上使用DNA技术,是很早就有的,但是真正的DNA系统是最近10年间才发展起来的。中国国内的DNA数据库系统,有数据量大,增长量快,比对复杂等特点。
目前主流公安机关使用的DNA系统 ,是由北京海鑫高科技有限公司和辽宁省公安厅刑事科学研究所共同研究的项目。该项目也列入了国家”十五“科技课题和公安厅的”金盾计划“。
针对近几年拐卖儿童案件逐年上升的趋势,公安部又组织开发建立了全国公安机关“打拐”DNA数据库,使许多被拐卖的孩子和家里亲人得以团聚。
(2)基因数据库扩展阅读:
中国DNA资料库始建于新世纪初,国家九五科技攻关项目法庭科学DNA数据库建设关键技术、国产化DNA试剂的研制等项目相继执行,标志着我国DNA数据库建设启动,而在公安机关打拐专项行动中建立全国打拐DNA数据库并实现异地查询,则标志着我国DNA数据库进入建设实施阶段。
至2010年12月,全国公安机关共建立了312个DNA实验室,其中283个与国家库联网,DNA数据总量达700余万份,居世界第2位,日均破案150余起。
参考资料来源:网络-DNA数据库
参考资料来源:网络-DNA资料库
3. ncbi基因组数据库包括了哪些文件
NCBI对BLAST进行了全新的改版,推出了最新的web BLAST report。在最新的BLAST比对结果页面中,“图形化概要(Graphic Summary)”、“具体描述(Descriptions)”以及“序列比对(Alignments)”等部分页面都可以展开和收起。此外,网页上还提供了“结果输出格式选项(Formatting)”和“结果下载选项(download)”,在下载选项中还新增了CSV格式下载。这样,读者可以轻松地将BLAST的比对结果输入到表格处理软件中去。另外,BLAST比对结果页面上的“Alignments”部分还提供了每一条命中序列在Entrez Gene中的相关信息,这些信息包括基因名称、来源物种以及在PubMed数据库中与该基因有关条目的数目等。
4. 存储基因数据,一般用什么数据库
基金数据可以使用mysql,sqlserver等关系型数据库
这种数据库存储效率高, 增删改查比较方便
5. 如何在网上查找一个疾病的所有相关基因
全基因组关联研究(GWAS)发现了数百种与复杂人类疾病相关的基因突变,但这些突变大部分对增加患病风险的贡献都非常小。遗传性似乎有一大部分无法被检测到。人们对遗传性中未能检测到的这一部分提出以下可能的解释:影响较小的大量变异体尚未发现;存在一些当前的基因型分析技术无法检测到的罕见的结构变异或表观遗传变异;以及存在难以检测到的基因与基因之间和基因与环境之间的相互作用。
在一篇“Review”文章中,Teri Manolio及其同事对最有可能将这些解释和其他可能的解释加以区分的研究策略进行了分析。
Finding the missing heritability of complex diseases
Teri A. Manolio1, Francis S. Collins2, Nancy J. Cox3, David B. Goldstein4, Lucia A. Hindorff5, David J. Hunter6, Mark I. McCarthy7, Erin M. Ramos5, Lon R. Cardon8, Aravinda Chakravarti9, Judy H. Cho10, Alan E. Guttmacher1, Augustine Kong11, Leonid Kruglyak12, Elaine Mardis13, Charles N. Rotimi14, Montgomery Slatkin15, David Valle9, Alice S. Whittemore16, Michael Boehnke17, Andrew G. Clark18, Evan E. Eichler19, Greg Gibson20, Jonathan L. Haines21, Trudy F. C. Mackay22, Steven A. McCarroll23 & Peter M. Visscher24
Genome-wide association studies have identified hundreds of genetic variants associated with complex human diseases and traits, and have provided valuable insights into their genetic architecture. Most variants identified so far confer relatively small increments in risk, and explain only a small proportion of familial clustering, leading many to question how the remaining, 'missing' heritability can be explained. Here we examine potential sources of missing heritability and propose research strategies, including and extending beyond current genome-wide association approaches, to illuminate the genetics of complex diseases and enhance its potential to enable effective disease prevention or treatment.
6. DNA数据库的EMBL
欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)创建的一个核酸序列数据库。EMBL的数据来源主要有两部分,一部分由科研人员或某些基因组测序机构通过计算机网络直接提交,另一部分则来自科技文献或专利(Stoesser等, 1998)。EMBL与DDBJ、GenBank建有合作关系,他们分别在全世界范围内收集核酸序列信息,每天都将新发现或更新过的数据相互交换。
DNA数据库的规模正在以指数方式增长,平均不到9个月就增加一倍。1998年1月,EMBL中收录的序列数已超过一百万,包括15,500个物种,其中模式生物的序列占50%以上,它们包括人类(Homo sapiens), 线虫(Caenorhabditis elegans),啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),小鼠(Mus musculus)和拟南芥(Arabidopsis thalania)。
可以利用序列查询系统 SRS(Sequence Retrieval System)从EMBL数据库中提取有关信息(Etzold等,1996年)。SRS序列查询系统通过超文本链接将DNA序列数据库和蛋白质序列、功能位点、结构、基因图谱以及文献摘要MEDLINE等各种数据库联系在一起。利用EBI网站提供的BLAST或FastA程序,可以对EMBL数据库进行未知序列同源性搜索。
7. 如何给孩子上dna数据库
这种数据库一般人是不会用到的。只有国家和有关部门机构还会有的吧。它会帮你记录孩子的信息。基因和基因组的资料
8. 人的基因数据库和指纹数据库有哪些不同
人类手指上的皮肤和身体的皮肤有很大不同。其一,手指皮肤有凸纹,没有毛发,不会有油脂,但却有很多汗孔;其二,指纹具有唯一性和稳定性,随着年龄的增长指纹上虽然会起皱,但是图案基本不变;其三,人手接触各种物体表面通常会留下痕迹。这些特性就使得指纹特别适合做身份识别,也即我们所说的“指纹识别”。
美国夏威夷大学癌症研究中心研究发现:女性左手指箕形纹如果开口向右的纹形较多,患乳癌的机会可能较高。英国学者的研究证实:斗纹越多,越容易患高血压。美国纽约大学的研究发现:老年痴呆病人组中,十指中有8个指头为小指侧箕型的人占72%,而对照组中只有26%;病人组中有14人的十指全部为小指侧箕型指纹,而对照组中只有4人。专家同时说,这仅是统计学的调查资料,并不意味着凡是十指中有8个指头是小指侧箕型纹的人,都一定会患上老年性痴呆症。
9. 求基因表达常用数据库
IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。
ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID,OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号(Havana transcript)。
http://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?db=core;g=ENSG00000067704;r=1:220267444-220321380;t=ENST00000490891
UCSC Microarray Expression Data 给出了基因mRNA在人类不同组织中的表达量
http://genome.ucsc.e/cgi-bin/hgGene?hgg_gene=uc001hmc.2&hgg_prot=B2RPG8&hgg_chrom=chr1&hgg_start=220267454&hgg_end=220321376&hgg_type=knownGene&db=hg19&hgsid=193781719
GEO数据库给出了详细的基因mRNA在不同组织中的表达数据,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
基因的表达量不等于转录本的表达量,特定转录本IARS2-003的表达量需要自行实验证明。
10. 基因数据库 一般使用什么数据库
集合所有已知核酸的核苷酸序列,单核苷酸多态性、结构、性质以及相关描述,包括它们的科学命名、来源物种分类名称、参考文献等信息的资料库。基因和基因组的资料也包含在DNA数据库中。目前国际上比较重要的核酸(含蛋白质)一级数据库有美国的GenBank、欧洲的EMBL和日本的DDBJ。三个数据库信息共享,每日交换,故资料是一样的,唯格式有所不同。