⑴ 怎么在数据库查年龄相关的基因差异
1、首先打开NC数据库，输入GDS5656，点击Search。
2、其次在GEO主页检索GSE50161，进入GSE50161的页面后采集必要信息。
3、最后使用NetworkAnalyst数据库筛选差异基因即可。
⑵ geo数据库差异基因怎么在EXCEL里操作
geo数据库筛选数据方法是：
1、首先，打开NCBI，选择GEODatasets，输入GDS5656，点击Search。
2、点击样品分类号，我们可以看到该研究的详情，包括文章研究内容、实验方案设计、样本详情等。
3、点击AnalyzewithGEO2R，利用在线工具进行数据分析。将4个样本分成了两组，分组完毕后，点击saveallresults，获取两组之间的差异表达基因。
4、得到如下所示的文本内容，将其粘贴到记事本(例如，保存为result.txt)，然后导入到excel中(数据→自文本，选择result.txt文件导入)，准备进行筛选。
5、下一步，我们需要对差异表达基因的数据进行进一步的筛选。
6、最后我们可以在EXCEL左下角的状态栏看到，一共筛选出来738个条目。
⑶ 如何在GEO数据库中比较两个子集 我想在两组芯片数据之间比较存在表达差异4倍以上的基因 应该怎么操作
你好，本公司是专门做生物信息数据处理的。
差异表达基因的筛选（阀值）以及后面的生物信息分析都可以做的。
差异表达基因筛选步骤：选择GEO数据——下载芯片数据——差异分析（方法有很多：SAM法，R包处理，T-test检验等）——选择想要的阈值（Fold change >4)
⑷ gcbi怎么进行差异基因的筛选
通过选择(q-value/差异倍数、差异数量)和设置差异参数，筛选样本中的差异基因。
(1) q-value越高，筛选出差异基因越多。q-value=0.05认为结果良好，可根据具体情况适当调整。
(2) 差异倍数常用：1.2、1.5、2，其中1.5最常用。
⑸ kegg数据库和geo数据库区别
GEO筛选差异，KOBAS注释分析。
GEO数据库来筛选差异表达基因，KOBAS进行KEGG注释分析
利用基因在不同物种之间的保守性，任何基因组的数据都可以映射到这些数据库中去。
⑹ 筛选差异基因的方法比较
Bonferroni校正法、Sidak 校正法和Hochberg 法可将FWER、FDR控制在很低的水平,但是筛选出的差异表达基因数比较少,不适用基因表达谱筛选差异表达基因的数据分析。相同样本量和方差条件下, 成组t检验方法筛选的差异表达基因数最多,但是不能有效地控制FW ER、FDR 水平, 筛选出的差异表达基因假阳性数过多。通过模拟实验发现, SAM 方法和BH 法筛选差异表达基因数、假阳性数、FWER 和FDR 均相差不大,均筛选出较多的差异表达基因,且控制了多重检验错误率。相同样本量和方差条件下, SAM 方法筛选出的差异表达基因数、约登指数略高于BH法,假阳性数略低于BH法。因此, SAM 方法适用于基因表达谱数据筛选差异表达基因的数据分析。
