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表达谱芯片及技术服务
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Phalanx及Illumina表达谱芯片
人类, 小鼠及大鼠。
表达谱定制芯片
Agilent任意物种定制芯片 (8×15K, 4×44K, 2×105K, 244K)，Phalanx 人或小鼠定制芯片 (2sample/array)，CombiMatrix任意物种定制芯片 (4×2K, 12K)。
SNP&CNV基因分型芯片及技术服务
Affymetrix SNP芯片
人类SNP6.0芯片及人类SNP5.0芯片
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Agilent microRNA芯片 (8x15K)
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人类及灵长类，小鼠及大鼠，模式动物 (I)，模式植物 (I)，模式动物 (II)，模式植物 (II)， 及任意物种定制芯片。
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人类CpG Island甲基化芯片 (244K)，小鼠CpG Island甲基化芯片(2×105K)，人类Promotor 启动子甲基化芯片 (244K×2)，小鼠Promotor 启动子甲基化芯片 (244K×2)等等。
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比较基因组杂交芯片及技术服务
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Ⅲ 小麦正常雄蕊变雌蕊是基因突变吗
来自知网
作者
唐海峰
摘要
HTS-1是一种新型的小麦雄蕊同源转化为雌蕊突变体,与普通小麦不同的是它的雄蕊部分或者全部同源转化为雌蕊,甚至我们可以在HTS-1中发现没有雄蕊但出现6个雌蕊或者6个雌蕊化结构的小花。因此HTS-1在研究小麦育种和花发育中具有很重要的...
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关键词
小麦；基因分型测序(GBS)；雄蕊同源转化为雌蕊突变体；Win基因
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知网
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Ⅳ 基因芯片技术的基本原理
基因芯片又称DNA芯片(DNA chip )或DNA微阵列(DNA microarray)。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法将大量特定序列的探针分子密集、有序地固定于经过相应处理的硅片、玻片、硝酸纤维素膜等载体上,然后加入标记的待测样品,进行多元杂交,通过杂交信号的强弱及分布,来分析目的分子的有无、数量及序列,从而获老者敏得受检样品的遗传信息。其工作原理与经典的核酸分子杂交如Southern和Northern印迹杂交一致,都是应用已知核酸序列与互补的靶序列杂交,根据杂交信号进行定性与定量分析。经典杂交方法固定的是靶序列,而基因芯片技术固定的是已知探针,因此基因芯片可被理解为一种反向杂交。基因芯片能够同时平行分析数万个基因,进行高通量筛选与检测分析,解决了传统核酸印迹杂交技术操作复杂、自动化程度低、检测目的分子数量少等不足。根据所用探针类型,基因芯片可分为cDNA ( comp lement DNA)芯片和寡核苷酸芯片;根据检测目的又可分为表达谱芯片和单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphisms, SNP)芯片。随着芯片技术在其他生命科学领域的延伸,基因芯片概念已泛化到生物芯片,包括基因芯片、蛋白质芯片、糖芯片、细胞芯片、流式芯片、组织芯片和芯片实验嫌差室( laboratory on a chip)等。
芯片基片可用材料有玻片、硅片、瓷片、聚丙烯膜、硝酸纤维素膜和尼龙膜,其中以玻片最为常用。为保证探针稳定固定于载体表面,需要对载体表面进行多聚赖氨酸修饰、醛基修饰、氨基修饰、巯基修饰、琼脂糖包被或丙烯酰胺硅烷化,使载体形成具有生物特异性的亲和表面。最后将制备好的探针固定到活化基片上,目前有两种方法:原位合成和合成后微点样。根据芯片所使用的标记物不同,相应信号检测方法有放射性核素法、生物素法和荧光染料法,在以玻片为载体的芯片上目前普遍采用荧光法。相应荧光检测装置有激光共聚焦显微镜、电荷偶合器( charge coup led devices, CCD)、激光扫描荧光显微镜和激光共聚焦扫描仪等。其中的激光共聚焦扫描仪已发展为基因芯片的配套检测系统。经过芯片扫描提取杂交信号之后,在数据分析之前,首先要扣除背景信号,进行数据检查、标化和校正,消除不同实验系统的误差。对于简单的检测或科学实验,因所需分析基因数量少,故直接观察即可得出结论。若涉及大量基因尤其是进行表达谱分析时,就需要借助专门的分析软件,运用统计学和生物信息学知识进行深入、系统的分析,如主成分分析、分层聚类分析、判别分析和调控网络分析等。芯片数据分析结束并不表示芯片实验的完成,由于基因芯片获取的信息量大,要对呈数量级增长的实验数据进行有效侍枝管理,需要建立起通行的数据储存和交流平台,将各实验室获得的实验结果集中起来形成共享的基因芯片数据库,以便于数据的交流及结果的评估。
Ⅳ 小麦基因芯片 90k k代表什么意思
k代表1000. 90k意思是90000个探针。
Ⅵ 生信如何在数据库中筛选某个基因低表达的患者
生信中可以通过在公共数据库中进行数据挖掘来筛选出某个基因低表达患者的信息。具体步骤如下：
1. 选择公共数据库：如NCBI、ENSEMBL等。
2. 输入关键词：通过输入关键词，如基因名、疾病名等来查找相关的数据。
3. 筛选条件：在搜索结果页面中，可以根据需要选择筛选条件，如样本类型、实验方法、表达量等。
4. 分析结果：根据筛选条件得到一批样本，可以进行数据分析，如表达谱分析、差异分渣碰析等。
5. 确定差异表达如段谈基因：通过数据分析得到差异表达基因，确定低表达的患者。
原因：生物信息学是通过计算机方法来处理与生物学相关的数据燃答，因此可以通过在公共数据库中进行数据挖掘，来筛选出某个基因低表达的患者。在生信研究中，这种方法被广泛运用，可以对基因表达进行深入的研究，为疾病的预防、诊断和治疗提供参考依据。
拓展：除了在公共数据库中进行数据挖掘，还可以使用一些生信工具来筛选差异表达基因，如DESeq2、edgeR等。这些工具可以帮助研究人员进行高通量数据的分析和解读，从而更准确地发现差异表达基因，为疾病的研究提供更全面的信息。