1. 请教千人基因组数据库中的一些问题~~~~~求前辈详细指教
vega:vertebrate genome annotation database;
HUGO:Human Genome Organization;
HGNC:The HUGO Gene Nomenclature Committee;
ENSEMBL:http://ke..com/view/2028023.htm;
CCDS:The consensus coding sequence;
括号里注明的是该基因诠释的来源----不同的数据库。
图中最左边的是Y染色体,右面的三列应该是做的统计。
第一列,genes和known genes表示在Y染色体对应的位置基因的数量,已知基因用红色柱,所有基因用空心柱,红色柱越长表示该区域的基因我们了解的越精细。
第二列,是统计DNA的GC含量和重复序列的比例,各有符号表示,根据颜色可辨别。
第三列,是统计突变位点,柱的长短代表了该区域的DNA的突变几率的大小。
2. 基因组数据库的简介
基因组数据库是分子生物信息数据库的重要组成部分。基因组数据库内容丰富、名目繁多、格式不一,分布在世界各地的信息中心、测序中心、以及和医学、生物学、农业等有关的研究机构和大学。基因组数据库的主体是模式生物基因组数据库,其中最主要的是由世界各国的人类基因组研究中心、测序中心构建的各种人类基因组数据库。小鼠、河豚鱼、拟南芥、水稻、线虫、果蝇、酵母、大肠杆菌等各种模式生物基因组数据库或基因组信息资源都可以在网上找到。随着资源基因组计划的普遍实施,几十种动物、植物基因组数据库也纷纷上网,如英国Roslin研究所的ArkDB包括了猪、牛、绵羊、山羊、马等家畜以及鹿、狗、鸡等基因组数据库,美国、英国、日本等国的基因组中心的斑马鱼、罗非鱼(Tilapia)、青鳉鱼(Medaka)、鲑鱼(Salmon)等鱼类基因组数据库。英国谷物网络组织(CropNet)建有玉米、大麦、高粱、菜豆农作物以及苜蓿(Alfalfa)、牧草(Forage)、玫瑰等基因组数据库。除了模式生物基因组数据库外,基因组信息资源还包括染色体、基因突变、遗传疾病、分类学、比较基因组、基因调控和表达、放射杂交、基因图谱等各种数据库。
3. 中国DNA数据库建立了吗
中国DNA数据库建立了。
中国国内的,在侦破案件上使用DNA技术,是很早就有的,但是真正的DNA系统是最近10年间才发展起来的。中国国内的DNA数据库系统,有数据量大,增长量快,比对复杂等特点。
目前主流公安机关使用的DNA系统 ,是由北京海鑫高科技有限公司和辽宁省公安厅刑事科学研究所共同研究的项目。该项目也列入了国家”十五“科技课题和公安厅的”金盾计划“。
针对近几年拐卖儿童案件逐年上升的趋势,公安部又组织开发建立了全国公安机关“打拐”DNA数据库,使许多被拐卖的孩子和家里亲人得以团聚。
(3)千人基因组数据库扩展阅读:
中国DNA资料库始建于新世纪初,国家九五科技攻关项目法庭科学DNA数据库建设关键技术、国产化DNA试剂的研制等项目相继执行,标志着我国DNA数据库建设启动,而在公安机关打拐专项行动中建立全国打拐DNA数据库并实现异地查询,则标志着我国DNA数据库进入建设实施阶段。
至2010年12月,全国公安机关共建立了312个DNA实验室,其中283个与国家库联网,DNA数据总量达700余万份,居世界第2位,日均破案150余起。
参考资料来源:网络-DNA数据库
参考资料来源:网络-DNA资料库