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pdb数据库软件

发布时间: 2022-04-22 04:56:23

‘壹’ 请问PDB数据库文件如何打开

1、打开vs2015,在菜单栏上找到“工具”---》“选项”。

‘贰’ PDB数据库网址是什么

http://www.uniprot.org/
新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成,美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元。这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放,各国研究人
员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费获取信息。(新浪网 2002年11月01日)
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。这些数据包括X光晶体衍射或者NMR核磁共振显示以及由全世界生物学家和生物化学家上传,在网上,它们可以通过PBD的会员组织(PDBe, PDBj, RCSB)免费获取。PDB是由一个叫做世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank, wwPDB)管理。PDB是结构生物(如结构基因组学)的一个关键性资源。大部分学术刊物,以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院(NIH)],现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB
从PDB的网站上,可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构,并可以将这个结构图下载到电脑中,通过PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等软件查看、编辑。 从PDB网站上下载的3D结构图的后缀名为.pdb。

‘叁’ oracle pdb数据库怎么打开

PDB全称为Pluggable Database,即可插拔数据库。
打开PDB数据库的方法有两种:
方式1:
SQL> alter pluggable database PDBEPPS open;

Pluggable database altered.

SQL> select con_id, dbid, guid, name , open_mode from v$pdbs;

CON_ID DBID GUID NAME OPEN_MODE

---------- ---------- -------------------------------- ------------------------------ ----------

2 4071321146 PDB$SEED READ ONLY

3 1930201447 PDBEPPS READ WRITE

方式2:
SQL> alter session set container=PDBEPPS;

Session altered.

SQL> startup

Pluggable Database opened.

‘肆’ 谁知道VC产生的程序数据库 (PDB) 文件有什么用什么时候用怎么用

使用
/Zi
选项编译的对象
(.obj)
文件包含程序数据库
(PDB)
的名称。不将对象的
PDB
文件名指定给链接器;如果需要,LINK
使用嵌入的名称查找
PDB。这同样适用于库中包含的可调试对象;可调试库的
PDB
必须可用于链接器和该库。
LINK
还使用
PDB
保存
.exe
文件或
.dll
文件的调试信息。程序的
PDB
既是输出文件也是输入文件,因为
LINK
在重新生成程序时更新
PDB。

‘伍’ pdb的数据

蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB) 是一个生物大分子(如蛋白质和核酸)数据库, 内容包括由全世界生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或者NMR核磁共振结构数据,这些数据可以通过PBD的会员组织(PDBe,PDBj,RCSB)免费获取。PDB是由世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank,wwPDB)管理。PDB是结构生物学的关键性资源,大部分学术刊物,以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院(NIH)],现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB。
从PDB的网站上,可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构,并可以将这个结构图下载到电脑中,通过PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等软件查看、编辑。
从PDB网站上下载的3D结构图的后缀名为.pdb。

‘陆’ oracle pdb和cdb的区别

区别一:包含关系不同

1、PDB全称为Pluggable Database,即可插拔数据库

2、CDB全称为Container Database,中文翻译为数据库容器,一个数据库容器(CDB)承载多个可插拔数据库(PDB)

区别二:用户使用时存放位置不同

1、COMMON USERS(普通用户):经常建立在CDB层,用户名以C##或c##开头;

2、LOCAL USERS(本地用户):仅建立在PDB层,建立的时候得指定CONTAINER。


(6)pdb数据库软件扩展阅读

CDB组件(Components of a CDB)

ROOT组件

ROOT又叫CDB$ROOT, 存储着ORACLE提供的元数据和Common User,元数据的一个例子是ORACLE提供的PL/SQL包的源代码,Common User 是指在每个容器中都存在的用户。

SEED组件

Seed又叫PDB$SEED,这个是你创建PDBS数据库的模板,你不能在Seed中添加或修改一个对象。一个CDB中有且只能有一个Seed. 这个感念,个人感觉非常类似SQL SERVER中的model数据库。

PDBS

CDB中可以有一个或多个PDBS,PDBS向后兼容,可以像以前在数据库中那样操作PDBS,这里指大多数常规操作。

这些组件中的每一个都可以被称为一个容器。因此,ROOT(根)是一个容器,Seed(种子)是一个容器,每个PDB是一个容器。每个容器在CDB中都有一个独一无二的的ID和名称。

‘柒’ 如何搜索PDB数据库

PDB是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。可以使用PalmReader打开。 如果想把PDB文件转换成TXT文件查看,可以使用WavePDB转。
程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息,使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。常见的VC80.PDB(更笼统地说就是 VCx0.PDB,其中 x 表示 Visual C++ 的版本。) 该文件存储各个 OBJ 文件的所有调试信息并与项目生成文件驻留在同一个目录中。

‘捌’ 怎么筛选PDB数据库中的蛋白

打开PDB数据库输入你知道的PDB编号 如果不知道编号就输入英文名称或者简称,搜索后出现蛋白质列表 一个个看 看哪个是你想要的.点一下,右上方有下载链接.下载xxx.pdb到本地磁盘后 用pymol或者rasmol软件打开看.或者用文本编辑器打开看详细的附加信息.