Ⅰ ftp 如何进行整个文件夹的下载
Linux系统的话可以试试这个：rsync
---links --recursive --times --verbose rsync://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/917/880 ./
可以下载的话，把ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/917/880 换成目标你要下载文件夹的路径就行
PS：上面是一条命令，是网络知道自动转2行的
Ⅱ 怎样用NCBI的FTP下载某物种的EST序列
ncbi ftp站点只有三个数据库 est_humanfasta,est_mouse.fasta,est_others.fasta.想获得某一物种的est库 可以到ncbi taxonomy主页输入物种名 页面有上角 就会出现该物种的详细信息，里面有EST记录 如果记录数目较大点击即可获得该物种的EST库
另外还可以从最近日期的blast数据库中est_others.fasta中用grep命令提取特定物种的est
Ⅲ wget如何下载一个NCBI网站目录下的全部文件,
wget -r -c -nH ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/geo/DATA/supplementary/series/GSE10145/
在-nH后加--cut-dirs=3 (ftp地址后的目录层数)就ok了!
Ⅳ 使用filezilla连接NCBI FTP服务器失败，求助
你好，ftp出现不能下载上传或者连接不上或者读取列表失败的情况，多半跟本地网络或者使用不同的ftp软件差异有关系，你可以尝试以下几种方法解决。1，更换ftp软件的连接模式，一般有被动模式和主动模式，更换一下试试。2，更换一下软件，建议用Fl...
Ⅳ 如何在ncbi的genebank下载人来基因组序列
这三种版本的序列释放的时间不一样，另外，是由不同的组织公布的。
GRCh37.p2这个版本的是由Genome Reference Consortium与2010年7月公布的，
HuRef这个版本是由 J Craig Venter Institute 于2007年5月公布的，
Celera这个版本的是由Celera公司与2001年11月公布的，
这三个版本序列有差异，但是都是人类一号染色体的基因序列，都是可以参考的，GRCh37.p2这个版本的最新，也许最详细。
Each file is named according to the abbreviation for the species,
whether the assembly is the reference assembly (_ref_) or an alternate
assembly (_alt_), the assembly name, and either the chromosome label
or the scaffold group (unlocalized, unplaced, or alts). 每个文件的命名参考以下：物种的简写；_ref_代表参考组装序列或_alt_代表备选组装序列；组装序列名称；以及染色体序号或框架群(unlocalized, unplaced, or alts).
Ⅵ NCBI 的FTP速度太慢，可能是服务端限制了速度，如何加速
这个软件有可能会帮助你 http://download.csdn.net/down/1103876/gtyi999 一般情况 只要管理员 才会 有 开放端口的权限。一个服务器如果系统防御与防火墙都很好，用那些FTP的 加速软件是根本不起效果的 不防向管理员申请端口带宽。
Ⅶ 怎么把 ftp 文件中的全部内容下载下来，我用的是ncbi。求帮助a
试试爱米云共享网盘，快捷方式和隐藏文件这样的都能下载。比ftp简单好用的多，空间自己可以设定的。不用像ftp还得专门搭建服务器，一键安装就能用了，操作特别简单。可以批量管理成员和权限、数据自动备份、数据去重、给单个或多个用户共享，版本控制挺多功能的。
Ⅷ 怎么从从ncbi的ftp上下了windows的本地blast
This document describes the "BLAST" databases available on the NCBI
FTP site under the /blast/db directory. The direct URL is:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db 本地BLAST数据库下载地址
1. General Introction
NCBI BLAST home pages (http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/) use a standard
set of BLAST databases for Nucleotide, Protein, and Translated BLAST
searches. These databases are made available in the /blast/db directory as
compressed archives (ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/) in pre-formatted
format.这些数据库是已经预先进行过makeblastdb命令的，下载后可以直接使用
The FASTA databases reside under the /blast/db/FASTA directory.
The pre-formatted databases offer the following advantages:
* The pre-formatted databases are smaller in size and therefore are
faster to download;
* Sequences in FASTA format can be generated from the pre-formatted
databases by the fastacmd utility; 可以从这些数据库文件中导出FASTA文件
* A convenient script (update_blastdb.pl) is available to download
the pre-formatted databases from the NCBI ftp site; 可用该脚本升级数据库
* Pre-formatting removes the need to run formatdb; 无需再运行建库命令行
* Taxonomy ids are available for each database entry.
Pre-formatted databases must be downloaded using the update_blastdb.pl
script or via FTP in binary mode. Documentation for the update_blastdb.pl
script can be obtained by running the script without any arguments (perl is
required). 下载数据库时，需要用到perl脚本update_blastdb.pl，或使用FTP下载工具
The compressed files downloaded must be inflated with gzip or other decompress
tools. The BLAST database files can then be extracted out of the resulting
tar file using tar program on Unix/Linux or WinZip and StuffIt Expander
on Windows and Macintosh platforms, respectively.下载的数据库为压缩包，要解压缩
Large databases are formatted in multiple 1 Gigabytes volumes, which
are named using the database.##.tar.gz convention. All relevant volumes
are required. An alias file is provided so that the database can be called
using the alias name without the extension (.nal or .pal). For example,
to call est database, simply use "-d est" option in the commandline
(without the quotes). 大的数据库通常分为多个压缩包，例如nr库有11个压缩包。所有的相关压缩包
都要下载，解压。解压缩会生成对应的库文件，同时生成一个nr.pal文件。检索nr库时输入-d nr 即可。
Certain databases are subsets of a larger parental database. For those
databases, alias and mask files, rather than actual databases, are provided.
The mask file needs the parent database to function properly. The parent
databases should be generated on the same day as the mask file. For
example, to use swissprot pre-formatted database, swissprot.tar.gz, one
will need to get the nr.tar.gz with the same date stamp. 有些数据库是大数据库
的子集，使用这些子集数据库时，必须同时下载其（相同日期的）大数据库
Additional BLAST databases that are not provided in pre-formatted
formats are available in the FASTA subdirectory. 有些BLAST数据库没有提供预先建库
的文件，这些数据库可以从FASTA文件夹里下载 For genomic BLAST
databases, please check the genomes ftp directory at:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/ 在这里下载基因组BLAST数据库
2. Contents of the /blast/db/ directory
The pre-formatted BLAST databases are archived in this directory. The
name of these databases and their contents are listed below.
数据库名称 数据库内容
+----------------------+-----------------------------------------------+
|File Name | Content Description |
+----------------------+-----------------------------------------------+
/FASTA | subdirectory for FASTA formatted sequences
存放FASTA格式序列的子文件夹
README | README for this subdirectory (this file)
env_nr.*tar.gz | Environmental protein sequences 环境蛋白序列
env_nt.*tar.gz | Environmental nucleotide sequences 环境核苷酸序列
est.*tar.gz | volumes of the formatted est database
| from the EST division of GenBank, EMBL,
| and DDBJ. EST数据库
Ⅸ NCBI ftp服务器中怎么找到某物种的蛋白信息（比如protein_protein interaction,sublocation,geneID)的汇总
难道不能直接从蛋白库里找么
Ⅹ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/M_musculus/这个怎么只能看不能下载啊
只要是文件夹的图标一直往里面点，遇到.gz
后缀的再点一下就弹出下载框了