㈠ 怎样根据pdb序列号找目的基因
1.文本打开晶体结构文件,把所有残基一个一个的拷贝下来,并改成单字母表示,就ok了。
2.在www.pdb.org里,找到你的晶体结构,Molecular Description下UniProtKB行的最后一个字符串是序列代码,点击进去就有一级序列了。
㈡ 我想从蛋白质的pdb文件中批量提取出序列的信息,怎么搞
你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中。
㈢ 后缀为pdb的文件能删除么
PDB文件是Palm OS操作系统上数据文件类型。一般我们在使用Palm系统的电子书时都会遇到这种文件,一般用于电子书或手机电子书 pdb是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。
project.PDB 该文件存储 .exe 文件的所有调试信息。还是不要随意删除~~~
㈣ 磁盘里自动生成了一堆pdb文件,简单来说它是干嘛的,我可以转移或者删掉吗
PDB文件是在我们编译工程的时候产生的,它是和对应的模块(exe或dll)一起生成出来的。
一般可能不会意识到PDB文件的重要性,因为如果只是我们本地进行开发,总是能够进行调适。
这里我要引入两个概念:Private Build和Public Build。
Private Build指的是在开发机器上的编译,Public Build指的是在负责编译的机器上的编译。
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㈤ 误删PDB的文件后如何删除PDB
场景:同事误删了PDB的文件,我们查看v$datafile,仍然存有删过的数据文件信息;此时cdb也起不来,所有pdb也都是mounted状态。直接删pdb的话会报错。
需要按如下方式删除pdb:
1.进入pdb中:
2.将误删的文件offline+drop
3.切换到cdb,删除pdb1并启动cdb
㈥ 怎样用pdb 做抗原抗体表位分析
如何利用生物学对蛋白的的抗原表位进行分析
蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生化分析;它为获得重要生命信息(如未知蛋白组分、序列。体内表达水平生物学功能、与其他分子的相互调控关系、物筛选、物靶位的选择等)提供有力的技术支持。
固体芯片的构建
常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。
探针的制备
低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物质、结合某些阳离子或阴离子的化学集团、受体和免疫复合物等具有生物活性的蛋白质。制备时常常采用直接点样法,以避免蛋白质的空间结构改变。保持它和样品的特异性结合能力。高密度蛋白质芯片一般为基因表达产物,如一个cDNA文库所产生的几乎所有蛋白质均排:列在一个载体表面 ,其芯池数目高达1600个/cm2,呈微距阵排列,点样时须用机械手进行,可同时检测数千个样品。
㈦ .net里Release的pdb文件有什么用 是否可以删除
程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息,使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。 在使用 /debug 生成时,会创建一个 PDB 文件。 可以使用 /debug:full 或 /debug:pdbonly 生成应用程序。 使用 /debug:full 生成将产生可调试的代码。 使用 /debug:pdbonly 生成将产生 PDB,但是不会产生通知 JIT 编译器调试信息可用的 DebuggableAttribute。 如果您想为不希望其成为可调试的发布版本生成 PDB,请使用 /debug:pdbonly。 有关更多信息,请参见 /debug (C# 编译器选项)或 /debug (Visual Basic)。
Visual Studio 调试器使用 EXE 或 DLL 文件中的 PDB 路径查找 project.pdb 文件。 如果调试器无法在该位置找到 PDB 文件,或者该路径无效,调试器将先搜索包含 EXE 的路径,然后搜索“选项”对话框中指定的符号路径。 该路径通常是“符号”节点中的“调试”文件夹。 如果调试器无法找到 .PDB 文件,则显示“查找符号”对话框,这将允许您搜索符号或向搜索路径添加其他位置。
Debug里的PDB是full,保存着调试和项目状态信息、有断言、堆栈检查等代码。
Release 里的PDB是pdb-only,基本上:出什么错了+错误在哪行。因为很多人把PDB理解成:调试文件、Program Debug Database、会泄露代码机密,所以想将其删除,那只要在VS的 项目-->生成-->高级-->调试信息-->None便可重要事项调试器只会为二进制文件加载与该二进制文件生成之时所创建的 PDB 完全相符的 PDB。 就是说,该 PDB 必须是原 PDB 或其副本。 因为编译器在创建二进制文件时会考虑多种因素,所以,即使代码自身没有变化,二进制文件的实际布局也可能会有变化。
㈧ VC链接问题:如何减小PDB文件
你最好在头文件中用上
#ifndef _xxx_
#define _xxx_
//你头文件中的内容
#endif
pdb太大只能说明你过多链接头文件了
㈨ bat命令:怎样删除当前目录和子目录下所有*.pdb文件
del /s *.pdb
另存为Bat,即可删除当前目录 以及子目录下的Pdb文件