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高通量存储

发布时间: 2022-11-14 07:09:06

1. 谁用过NCBI的CDD数据库

NCBI的产生和发展是在美国和全球生物学高速发展,高通量数据急速产生,而缺乏有效的数据分析方法的背景下产生,起初它主要任务是数据的存储和查询。只不过其存储的数据大多以高通量数据为主,例如基因测序,基因组,SNP, 基因芯片,小分子化合物和GWAS数据等。这些数据的共享,极大地促进了生物信息学发展。

按照数据->样式->知识->智慧的发展模式,NCBI主要起到了一个为生物学家提供数据的角色。不过,NCBI目前也不断地在调整自己的角色。例如,生物医学文献。NCBI在从NLM继承过来的pubmed的基础,提供以PMC数据库为核心的全文文献服务。PubMed数据库应该是全球生物学家使用频率最高的数据库。NCBI最近对pubmed的改版,虽然没有实质性的改变,但其按照用户体验进行的修改,足见其对该数据库的重视。

另外,NCBI目前不断地在引入高学历生物学人才对其数据库的质量进行控制。以dbSNP为例,其正在通过与领域专家的合作将突变数据与人类表型数据进行关联。

总得来讲,NCBI的发展是与生物学高通量数据产生密切相关,它以经不在局限于提供数据存储与查询,其未来的发展必将发展为一个大型的、综合的知识库。到那时NCBI会不会免费,就要另当别论了。很显然没有人会将自己的手稿拱手让人。如果真有那么一天,不知道从中会产生多少专利和知识产权。

2. 中科声龙有哪些技术优势

创新运用的3D-TSV堆叠技术,它能够在提升芯片结构功能密度和缩短互连长度的同时,进一步提升产品的系统性能,降低整体功耗。英特尔INTEL,桌面/服务器将复杂做到极致,ARM移动终端将功耗做到极致,英伟达NVIDIA矩阵计算将并行做到极致,中科声龙可谓是把带宽做到极致。

3. NCBI有多少数据库,分别有什么作用

在生物医学信息学领域,数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同,如果要问NCBI过去,现在或将来会有多少数据库,恐怕连NCBI自己都说不清楚。要是一个一个数据库讲下来,9999个字肯定不够用。这里有一个列表供您参考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/。

NCBI的产生和发展是在美国和全球生物学高速发展,高通量数据急速产生,而缺乏有效的数据分析方法的背景下产生,起初它主要任务是数据的存储和查询。只不过其存储的数据大多以高通量数据为主,例如基因测序,基因组,SNP, 基因芯片,小分子化合物和GWAS数据等。这些数据的共享,极大地促进了生物信息学发展。

按照数据->样式->知识->智慧的发展模式,NCBI主要起到了一个为生物学家提供数据的角色。不过,NCBI目前也不断地在调整自己的角色。例如,生物医学文献。NCBI在从NLM继承过来的pubmed的基础,提供以PMC数据库为核心的全文文献服务。PubMed数据库应该是全球生物学家使用频率最高的数据库。NCBI最近对pubmed的改版,虽然没有实质性的改变,但其按照用户体验进行的修改,足见其对该数据库的重视。

另外,NCBI目前不断地在引入高学历生物学人才对其数据库的质量进行控制。以dbSNP为例,其正在通过与领域专家的合作将突变数据与人类表型数据进行关联。

总得来讲,NCBI的发展是与生物学高通量数据产生密切相关,它以经不在局限于提供数据存储与查询,其未来的发展必将发展为一个大型的、综合的知识库。到那时NCBI会不会免费,就要另当别论了。很显然没有人会将自己的手稿拱手让人。如果真有那么一天,不知道从中会产生多少专利和知识产权。

4. 第二代测序技术(NGS)是什么,有什么优势


NGS又叫高通量测序,当传统的癌症治疗不起作用,或者医生不能确定患者的癌症起源(原发灶)时,NGS(二代测序)可以帮助确定肿瘤中的基因突变,这些突变可能与某些针对特定变异的药物相匹配。NGS主要优势是通量大,可以得到海量的数据,高通量最小的数据量单位是G,而一代测序一次只能产生1K的数据。

NGS对晚期癌症患者的用处有多大,有研究表明:
1、在80.5%的患者中发现了潜在的可操作的基因组变异;
2、在接受测序指导治疗的132名患者中,37.1%的患者取得了临床获益,19.7%的患者获得了超级应答(定义为将他们的疾病控制至少一年);
3、对于原发灶不明癌患者,在近一半(50.9%)的病例中,NGS解决了组织溯源问题,为医生提供更好的线索,了解哪些标准疗法和靶向疗法可能会有所帮助;
4、在15.8%的癌症患者中发现了潜在的可遗传胚系致病变异(增加患癌风险),其中4.8%与靶向治疗相关。

了解更多关于第二代测序技术的信息,推荐咨询海普洛斯。海普洛斯在基因测序、液体活检、生物信息和大数据等领域具有独创技术和核心优势,旗下医学检验实验室具有国际顶尖基因测序平台以及完善的国际标准质量体系。【● 没病有必要做基因检测吗?过来人有话说......】

5. 高通量DNA测序和基因组学新型技术的内容提要

三十年前,由Sanger和G订bert分别建立了DNA双脱氧测序和化学测序技术。现在DNA测序的规模逐渐扩大,从每天能读几千个碱基对序列的小规模测序,发展到如
今每天能够进行成千上万个序列的精确测定,成为数十亿美元的“产业”。世界上几个大的测序中心建立了大规模的基因组测序平台,支持几乎所有大学和大型医院的DNA测序工作。国际生物信息学中心拥有存储约一千五百万碱基对序列信息的能力,我们正处于一个“后基因组”时代。然而DNA测序在生命科学和医学的许多领域,仍然是一个主要的诊断和研究手段。这种强劲的需求,推动了新的测序技术的发展。这些新技术既不用电泳,也不用Sanger测序方法,而是通过DNA合成的方法进行测序,包括在固相表面上进行的多重平行测序反应,每一个循环的数据通过成像的方法获得。最近有一项由454生命科学和马普研究所制定的计划,使用合成法测序技术测定穴居人基因组,该计划显示了这些新的DNA测序技术在后基因组学研究中的强大作用。这将成为第二代全人类基因组项目,而且预计将进一步陕速提升我们对人类基因组生物学知识的认识,加深我们对人类遗传性疾病机制的了解。
本书汇集了DNA测序技术的一些新的进展,全书的框架由一系列综述组成,主要包括Sange,和SBS测序方法的进展(KumarandFuller)、毛细管电泳和微型集成系统
(XiongandCheng)、MS测序(Ehrichetal.)和应用(Mitchelsonetal.)。还包括了一些最新的进展,如SBS技术的新进展(Marguliesetal.)、核酸染料SBS测序方法(Edwardsetal.)、通过循环合成实现单分子测序(HebertandBrasiavsky)、纳米孔测序(LeeandMeller),以及阵列DNA的光标测(Schwartzetal.)。在书的最后,讨论了基因组拼接(Mc(;rath)中的生物信息学工具、古代和环境DNA样品(Kowalchuketal.)的测序和SBS序列拼接工具(Keithetal.)等SBs测序的新应用。作者真诚希望此书的出版和发行能够引起学生和研究人员对测序这个关键基因组学技术的兴趣,并引发相关的技术革新。

6. zinc数据库里面有多少小分子

在生物医学信息学领域,数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同,如果要问NCBI过去,现在或将来会有多少数据库,恐怕连NCBI自己都说不清楚.要是一个一个数据库讲下来,9999个字肯定不够用.这里有一个列表供您参考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/all/.
NCBI的产生和发展是在美国和全球生物学高速发展,高通量数据急速产生,而缺乏有效的数据分析方法的背景下产生,起初它主要任务是数据的存储和查询.只不过其存储的数据大多以高通量数据为主,例如基因测序,基因组,SNP,基因芯片,小分子化合物和GWAS数据等.这些数据的共享,极大地促进了生物信息学发展.
按照数据->样式->知识->智慧的发展模式,NCBI主要起到了一个为生物学家提供数据的角色.不过,NCBI目前也不断地在调整自己的角色.例如,生物医学文献.NCBI在从NLM继承过来的pubmed的基础,提供以PMC数据库为核心的全文文献服务.PubMed数据库应该是全球生物学家使用频率最高的数据库.NCBI最近对pubmed的改版,虽然没有实质性的改变,但其按照用户体验进行的修改,足见其对该数据库的重视.
另外,NCBI目前不断地在引入高学历生物学人才对其数据库的质量进行控制.以dbSNP为例,其正在通过与领域专家的合作将突变数据与人类表型数据进行关联.
总得来讲,NCBI的发展是与生物学高通量数据产生密切相关,它以经不在局限于提供数据存储与查询,其未来的发展必将发展为一个大型的、综合的知识库.到那时NCBI会不会免费,就要另当别论了.很显然没有人会将自己的手稿拱手让人.如果真有那么一天,不知道从中会产生多少专利和知识产权.

7. 谈谈基因测序技术经历了哪几个发展阶段,这些技术的特点分别是什么

基因测序也称DNA测序,是现代生物学研究中重要的手段之一。基因测序技术经过了三个发展阶段。第一代DNA测序技术是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)提出的链终止法。第一代技术准确率高,读取长,是至今唯一可以进行“从头至尾”测序的方法,但存在成本高、速度慢等方面的不足,并不是最理想的测序方法。使用第一代Sanger测序技术完成的人类基因组计划,花费了30亿美元巨资,用了十三年的时间。
随后的二、三代测序技术以高通量为共同特征,也被称为“新一代测序技术(NGS)”。Roche公司的454测序平台、Illumina公司的Solexa测序系统以及ABI公司的SOLID测序系统标志着第二代测序技术诞生。尽管各系统在高通量水平、测序准确度、存储格式、技术方法上各有差异,但共同特征是大大降低了测序成本并极大地提高了测序速度,完成一个人的基因组测序只需一周左右时间。然而第二代测序技术在测序前要通过PCR段对待测片段进行扩增,增加了测序的错误率。而且二代测序产生的测序结果长度较短,需要对测序结果进行人工拼接,因此比较适合于对已知序列的基因组进行重新测序,而在对全新的基因组进行测序时还需要结合第一代测序技术。
近期出现的Helicos公司的Heliscope单分子测序仪、Pacific Biosciences公司的SMRT技术、Oxford Nanopore Technologies公司正在研究的纳米孔单分子技术,被认为是第三代测序技术。与前两代技术相比,其最大的特点是单分子测序。第三代测序技术解决了错误率的问题,通过增加荧光的信号强度及提高仪器的灵敏度等方法,使测序不再需要PCR扩增这个环节,实现了单分子测序并继承了高通量测序的优点。更多基因相关资讯可登陆盛景基因查看。

8. 东南大学师生将校训存入DNA序列,你如何看待这件事

东南大学师生将校训存入DNA序列,你如何看待这件事?下面就我们来针对这个问题进行一番探讨,希望这些内容能够帮到有需要的朋友们。

历史悠久,出身名门

东南大学成立于1902年,历史悠久。1952年,中华人民共和国成立之初,原国立中央大学(南京大学)工程学院被纳入复旦大学、交通大学、浙江大学、金陵大学等相关部门,并于1952年建立了相应的部门。东南大学于一九八八年更名。合并南京铁路医学院、南京交通大学、南京地质学院。

今天的东南大学,在某些标榜上,让人更清楚地认识到自己的价值。中央直属、985工程大学、211工程大学、双一流建设大学、自主招生研究生等国家认可的专业类别。非营利性标志包括:建筑老八校,四大学院之一。

9. 东南大学师生将校训存入DNA序列,你是怎样看待这件事的

东南大学生物科学与医学工程学院、生物电子学国家重点实验室刘宏教授团队报道了集成化DNA存储系统方面的研究进展,通过电极表面合成DNA分子及原位测序实现了单电极上数据写入和读取的一体化,为实现未来的高通量自动化DNA存储系统打下基础。相关成果以“Electrochemical DNA synthesis and sequencing on a single electrode with scalability for integrated data storage”为题在国际着名期刊Science Advances发表。

从东南大学的发展历史、师资力量雄厚和取得的丰硕成果来看,东南大学实力非常强悍,它的通信、电子、建筑、交通、生物医学工程等在国内都是顶尖的。