‘壹’ shell脚本书写方法
在shell学习过程中，感觉挺有用的一份比较，略整理分享给大家。
首先，shell的作用
用户的登陆shell 登陆后默认的shell程序是： /bin/bash
不同的shell内部指令，运行环境会有所区别
常见的shell有
/bin/sh
/bin/bash
/sbin/nologin
1.编写脚本代码：
使用vi编辑器，每行一条Linux命令，按照顺序执行
2.然后赋予脚本文件可执行的属性
3.执行脚本文件的三种方法
./chao.sh
sh /chao.sh
source /chao.sh
更完善的脚本构成
注释信息
可执行语句
重定向操作
类型 操作符 用途
重定向输入 < 从指定文件读取而不是从键盘输入
重定向输出 > 将输出文件保存到指定文件（覆盖原有内容）
>> 将输出文件保存到指定文件（覆盖原有内容）
标准错误输出 2> 将错误信息保存到指定的文件（覆盖原有内容）
2>> 将错误信息保存到指定的文件
混合输出 &> 将标准输出，标准错误的内容保存到同一文件中
管道操作符号“|”
将左侧的命令输出结果，作为右侧命令的处理对象
shell变量的作用
为灵活管理Linux系统提供的特定参数，有两层意思
变量名：使用固定的名称，由系统预设或用户定义
变量值： 能够根据用户设置，系统环境的变化而变化
变量的类型
自定义变量：由用户自己定义，修改和使用
环境变量： 由系统维护，用于设置工作环境
位置变量： 通过命令行给脚本程序传递参数
预定义变量：BASH中内置的一类变量，不能直接修改
定义一个新的变量
格式： 变量名=变量值
变量名以字母或下划线开头，区分大小写，建议全大写
查看变量的值： echo $变量名
赋值时使用引号：
双引号：允许使用$符引用其他变量值
单引号： 禁止引用其他变量值，$视为普通字符
反撇号：命令替换，提取命令执行后的输出结果
将键盘输入内容为变量赋值
格式： read [-p "提示信息"] 变量名
设置变量的作用范围
export 变量名
export 变量名=变量值
两种格式可以混合使用
整数变量的运算：
expr 变量1 运算符 变量2 [运算符 变量3]
常见的运算符
加法运算符 +
减法运算符： -
乘法运算符：\*
除法运算符： /
取余运算：%
整数变量的运算（2）
（（变量=变量运算符变量））；
等号后面的变量可以是具体数值
例子：
（（a=a+3））；
环境变量：
由系统提前创建，用来设置用户的工作环境
配置文件： /etc/profile ~/.bash_profile
常见环境变量的举例
位置变量：
表示为$n, n为1~9之间的数字
预定义变量：
/etc/passwd /etc/shadow
例如一些服务的内置用户名或密码
如apache的启动用户就是预定义变量
条件测试操作
测试特定的 表达式是否成立，当条件成立时，测试语句的返回值为0，否则为其他数值
格式 ： test 条件表达式
应用实例：
test -z 进行测试的时候 字符串长度为0的时候 结果才返回1
如果变量数值为0 返回0
条件测试操作
[ 操作符 文件或目录]
[5] 部分是判断表达式，-d表示判断是否是目录
&&是”逻辑与“操作符，只有&&前面的判断成立，后面的语句才会执行
-b的意思是判断 后面的路径是否是一个目录
echo $? 表示对刚刚执行的表达式进行判断
0表示成立，1表示不成立
-e filename 如果 filename存在，则为真 [ -e /var/log/syslog ]
-d filename 如果 filename为目录，则为真 [ -d /tmp/mydir ]
-f filename 如果 filename为常规文件，则为真 [ -f /usr/bin/grep ]
-L filename 如果 filename为符号链接，则为真 [ -L /usr/bin/grep ]
-r filename 如果 filename可读，则为真 [ -r /var/log/syslog ]
-w filename 如果 filename可写，则为真 [ -w /var/mytmp.txt ]
-x filename 如果 filename可执行，则为真 [ -L /usr/bin/grep ]
filename1-nt filename2 如果 filename1比 filename2新，则为真 [ /tmp/install/etc/services -nt /etc/services ]
filename1-ot filename2 如果 filename1比 filename2旧，则为真 [ /boot/bzImage -ot arch/i386/boot/bzImage ]
字符串比较运算符 （请注意引号的使用，这是防止空格扰乱代码的好方法）
-z string 如果 string长度为零，则为真 [ -z "$myvar" ]
-n string 如果 string长度非零，则为真 [ -n "$myvar" ]
string1= string2 如果 string1与 string2相同，则为真 [ "$myvar" = "one two three" ]
string1!= string2 如果 string1与 string2不同，则为真 [ "$myvar" != "one two three" ]
算术比较运算符
num1-eq num2 等于 [ 3 -eq $mynum ]
num1-ne num2 不等于 [ 3 -ne $mynum ]
num1-lt num2 小于 [ 3 -lt $mynum ]
num1-le num2 小于或等于 [ 3 -le $mynum ]
num1-gt num2 大于 [ 3 -gt $mynum ]
num1-ge num2 大于或等于 [ 3 -ge $mynum ]
整数值比较
格式： [ 整数1 操作符 整数2 ]
字符串比较
格式1： [ 字符串1 = 字符串2 ]
[ 字符串1 ！= 字符串2 ]
格式2： [ -z 字符串 ]
逻辑测试：
格式1： [ 表达式1 ] 操作符 [ 表达式2 ]
格式2： 命令1 操作符 命令2
if语句的结构
while语句的语法结构
‘贰’ 如何用xshell编写脚本
1、在编写shell脚本的时候一般会先查询服务器可以使用哪种脚本，并且查看服务器使用的默认脚本方式是哪一种。
‘叁’ 如何在shell脚本中修改添加替换指定文件中的内容
1、可以借助.shell命令执行另一个脚本文件或者用变量保存。比如a.sh和b.sh，a.sh中调用b.sh的代码，一起输出"hello world"的字符串。b.sh的代码如下echo " world!"。
‘肆’ 如何编写一个shell脚本
如何编写一个shell脚本
本文结合大量实例阐述如何编写一个shell脚本。
为什么要进行shell编程
在Linux系统中，虽然有各种各样的图形化接口工具，但是sell仍然是一个非常灵活的工具。Shell不仅仅是命令的收集，而且是一门非常棒的编程语言。您可以通过使用shell使大量的任务自动化，shell特别擅长系统管理任务，尤其适合那些易用性、可维护性和便携性比效率更重要的任务。
下面，让我们一起来看看shell是如何工作的：
建立一个脚本
Linux中有好多中不同的shell，但是通常我们使用bash (bourne again shell) 进行shell编程，因为bash是免费的并且很容易使用。所以在本文中笔者所提供的脚本都是使用bash（但是在大多数情况下，这些脚本同样可以在bash的大姐，bourne shell中运行）。
如同其他语言一样，通过我们使用任意一种文字编辑器，比如nedit、kedit、emacs、vi
等来编写我们的shell程序。
程序必须以下面的行开始（必须方在文件的第一行）：
#!/bin/sh
符号#!用来告诉系统它后面的参数是用来执行该文件的程序。在这个例子中我们使用/bin/sh来执行程序。
当编辑好脚本时，如果要执行该脚本，还必须使其可执行。
要使脚本可执行：
chmod +x filename
然后，您可以通过输入： ./filename 来执行您的脚本。
注释
在进行shell编程时，以#开头的句子表示注释，直到这一行的结束。我们真诚地建议您在程序中使用注释。如果您使用了注释，那么即使相当长的时间内没有使用该脚本，您也能在很短的时间内明白该脚本的作用及工作原理。
变量
在其他编程语言中您必须使用变量。在shell编程中，所有的变量都由字符串组成，并且您不需要对变量进行声明。要赋值给一个变量，您可以这样写：
变量名=值
取出变量值可以加一个美元符号（$）在变量前面：
#!/bin/sh
#对变量赋值：
a="hello world"
# 现在打印变量a的内容：
echo "A is:"
echo $a
在您的编辑器中输入以上内容，然后将其保存为一个文件first。之后执行chmod +x first
使其可执行，最后输入./first执行该脚本。
这个脚本将会输出：
A is:
hello world
有时候变量名很容易与其他文字混淆，比如：
num=2
echo "this is the $numnd"
这并不会打印出"this is the 2nd"，而仅仅打印"this is the "，因为shell会去搜索变量numnd的值，但是这个变量时没有值的。可以使用花括号来告诉shell我们要打印的是num变量：
num=2
echo "this is the ${num}nd"
这将打印： this is the 2nd
有许多变量是系统自动设定的，这将在后面使用这些变量时进行讨论。
如果您需要处理数学表达式，那么您需要使用诸如expr等程序（见下面）。
除了一般的仅在程序内有效的shell变量以外，还有环境变量。由export关键字处理过的变量叫做环境变量。我们不对环境变量进行讨论，因为通常情况下仅仅在登录脚本中使用环境变量。
Shell命令和流程控制
在shell脚本中可以使用三类命令：
1)Unix 命令:
虽然在shell脚本中可以使用任意的unix命令，但是还是由一些相对更常用的命令。这些命令通常是用来进行文件和文字操作的。
常用命令语法及功能
echo "some text": 将文字内容打印在屏幕上
ls: 文件列表
wc –l filewc -w filewc -c file: 计算文件行数计算文件中的单词数计算文件中的字符数
cp sourcefile destfile: 文件拷贝
mv oldname newname : 重命名文件或移动文件
rm file: 删除文件
grep 'pattern' file: 在文件内搜索字符串比如：grep 'searchstring' file.txt
cut -b colnum file: 指定欲显示的文件内容范围，并将它们输出到标准输出设备比如：输出每行第5个到第9个字符cut -b5-9 file.txt千万不要和cat命令混淆，这是两个完全不同的命令
cat file.txt: 输出文件内容到标准输出设备（屏幕）上
file somefile: 得到文件类型
read var: 提示用户输入，并将输入赋值给变量
sort file.txt: 对file.txt文件中的行进行排序
uniq: 删除文本文件中出现的行列比如： sort file.txt | uniq
expr: 进行数学运算Example: add 2 and 3expr 2 "+" 3
find: 搜索文件比如：根据文件名搜索find . -name filename -print
tee: 将数据输出到标准输出设备(屏幕) 和文件比如：somecommand | tee outfile
basename file: 返回不包含路径的文件名比如： basename /bin/tux将返回 tux
dirname file: 返回文件所在路径比如：dirname /bin/tux将返回 /bin
head file: 打印文本文件开头几行
tail file : 打印文本文件末尾几行
sed: Sed是一个基本的查找替换程序。可以从标准输入（比如命令管道）读入文本，并将结果输出到标准输出（屏幕）。该命令采用正则表达式（见参考）进行搜索。不要和shell中的通配符相混淆。比如：将linuxfocus 替换为 LinuxFocus ：cat text.file | sed 's/linuxfocus/LinuxFocus/' > newtext.file
awk: awk 用来从文本文件中提取字段。缺省地，字段分割符是空格，可以使用-F指定其他分割符。cat file.txt | awk -F, '{print $1 "," $3 }'这里我们使用，作为字段分割符，同时打印第一个和第三个字段。如果该文件内容如下： Adam Bor, 34, IndiaKerry Miller, 22, USA命令输出结果为：Adam Bor, IndiaKerry Miller, USA
2) 概念: 管道, 重定向和 backtick
这些不是系统命令，但是他们真的很重要。
管道 (|) 将一个命令的输出作为另外一个命令的输入。
grep "hello" file.txt | wc -l
在file.txt中搜索包含有”hello”的行并计算其行数。
在这里grep命令的输出作为wc命令的输入。当然您可以使用多个命令。
重定向：将命令的结果输出到文件，而不是标准输出（屏幕）。
> 写入文件并覆盖旧文件
>> 加到文件的尾部，保留旧文件内容。
反短斜线
使用反短斜线可以将一个命令的输出作为另外一个命令的一个命令行参数。
命令：
find . -mtime -1 -type f -print
用来查找过去24小时（-mtime –2则表示过去48小时）内修改过的文件。如果您想将所有查找到的文件打一个包，则可以使用以下脚本：
#!/bin/sh
# The ticks are backticks (`) not normal quotes ('):
tar -zcvf lastmod.tar.gz `find . -mtime -1 -type f -print`
3) 流程控制
"if" 表达式 如果条件为真则执行then后面的部分：
if ....; then
....
elif ....; then
....
else
....
fi
大多数情况下，可以使用测试命令来对条件进行测试。比如可以比较字符串、判断文件是否存在及是否可读等等…
通常用" [ ] "来表示条件测试。注意这里的空格很重要。要确保方括号的空格。
[ -f "somefile" ] ：判断是否是一个文件
[ -x "/bin/ls" ] ：判断/bin/ls是否存在并有可执行权限
[ -n "$var" ] ：判断$var变量是否有值
[ "$a" = "$b" ] ：判断$a和$b是否相等
执行man test可以查看所有测试表达式可以比较和判断的类型。
直接执行以下脚本：
#!/bin/sh
if [ "$SHELL" = "/bin/bash" ]; then
echo "your login shell is the bash (bourne again shell)"
else
echo "your login shell is not bash but $SHELL"
fi
变量$SHELL包含了登录shell的名称，我们和/bin/bash进行了比较。
快捷操作符
熟悉C语言的朋友可能会很喜欢下面的表达式：
[ -f "/etc/shadow" ] && echo "This computer uses shadow passwors"
这里 && 就是一个快捷操作符，如果左边的表达式为真则执行右边的语句。您也可以认为是逻辑运算中的与操作。上例中表示如果/etc/shadow文件存在则打印” This computer uses shadow passwors”。同样或操作(||)在shell编程中也是可用的。这里有个例子：
#!/bin/sh
mailfolder=/var/spool/mail/james
[ -r "$mailfolder" ]' '{ echo "Can not read $mailfolder" ; exit 1; }
echo "$mailfolder has mail from:"
grep "^From " $mailfolder
该脚本首先判断mailfolder是否可读。如果可读则打印该文件中的"From" 一行。如果不可读则或操作生效，打印错误信息后脚本退出。这里有个问题，那就是我们必须有两个命令：
-打印错误信息
-退出程序
我们使用花括号以匿名函数的形式将两个命令放到一起作为一个命令使用。一般函数将在下文提及。
不用与和或操作符，我们也可以用if表达式作任何事情，但是使用与或操作符会更便利很多。
case表达式可以用来匹配一个给定的字符串，而不是数字。
case ... in
...) do something here ;;
esac
让我们看一个例子。 file命令可以辨别出一个给定文件的文件类型，比如：
file lf.gz
这将返回：
lf.gz: gzip compressed data, deflated, original filename,
last modified: Mon Aug 27 23:09:18 2001, os: Unix
我们利用这一点写了一个叫做smartzip的脚本，该脚本可以自动解压bzip2, gzip 和zip 类型的压缩文件：
#!/bin/sh
ftype=`file "$1"`
case "$ftype" in
"$1: Zip archive"*)
unzip "$1" ;;
"$1: gzip compressed"*)
gunzip "$1" ;;
"$1: bzip2 compressed"*)
bunzip2 "$1" ;;
*) error "File $1 can not be uncompressed with smartzip";;
esac
您可能注意到我们在这里使用了一个特殊的变量$1。该变量包含了传递给该程序的第一个参数值。也就是说，当我们运行：
smartzip articles.zip
$1 就是字符串 articles.zip
select 表达式是一种bash的扩展应用，尤其擅长于交互式使用。用户可以从一组不同的值中进行选择。
select var in ... ; do
break
done
.... now $var can be used ....
下面是一个例子：
#!/bin/sh
echo "What is your favourite OS?"
select var in "Linux" "Gnu Hurd" "Free BSD" "Other"; do
break
done
echo "You have selected $var"
下面是该脚本运行的结果：
What is your favourite OS?
1) Linux
2) Gnu Hurd
3) Free BSD
4) Other
#? 1
You have selected Linux
您也可以在shell中使用如下的loop表达式：
while ...; do
....
done
while-loop 将运行直到表达式测试为真。will run while the expression that we test for is true. 关键字"break" 用来跳出循环。而关键字”continue”用来不执行余下的部分而直接跳到下一个循环。
for-loop表达式查看一个字符串行表 (字符串用空格分隔) 然后将其赋给一个变量：
for var in ....; do
....
done
在下面的例子中，将分别打印ABC到屏幕上：
#!/bin/sh
for var in A B C ; do
echo "var is $var"
done
下面是一个更为有用的脚本showrpm，其功能是打印一些RPM包的统计信息：
#!/bin/sh
# list a content summary of a number of RPM packages
# USAGE: showrpm rpmfile1 rpmfile2 ...
# EXAMPLE: showrpm /cdrom/RedHat/RPMS/*.rpm
for rpmpackage in $*; do
if [ -r "$rpmpackage" ];then
echo "=============== $rpmpackage =============="
rpm -qi -p $rpmpackage
else
echo "ERROR: cannot read file $rpmpackage"
fi
done
这里出现了第二个特殊的变量$*，该变量包含了所有输入的命令行参数值。如果您运行showrpm openssh.rpm w3m.rpm webgrep.rpm
此时 $* 包含了 3 个字符串，即openssh.rpm, w3m.rpm and webgrep.rpm.
引号
在向程序传递任何参数之前，程序会扩展通配符和变量。这里所谓扩展的意思是程序会把通配符（比如*）替换成合适的文件名，它变量替换成变量值。为了防止程序作这种替换，您可以使用引号：让我们来看一个例子，假设在当前目录下有一些文件，两个jpg文件， mail.jpg 和tux.jpg。
#!/bin/sh
echo *.jpg
这将打印出"mail.jpg tux.jpg"的结果。
引号 (单引号和双引号) 将防止这种通配符扩展：
#!/bin/sh
echo "*.jpg"
echo '*.jpg'
这将打印"*.jpg" 两次。
单引号更严格一些。它可以防止任何变量扩展。双引号可以防止通配符扩展但允许变量扩展。
#!/bin/sh
echo $SHELL
echo "$SHELL"
echo '$SHELL'
运行结果为：
/bin/bash
/bin/bash
$SHELL
最后，还有一种防止这种扩展的方法，那就是使用转义字符——反斜杆：
echo *.jpg
echo $SHELL
这将输出：
*.jpg
$SHELL
Here documents
当要将几行文字传递给一个命令时，here documents（译者注：目前还没有见到过对该词适合的翻译）一种不错的方法。对每个脚本写一段帮助性的文字是很有用的，此时如果我们四有那个here documents就不必用echo函数一行行输出。 一个 "Here document" 以 << 开头，后面接上一个字符串，这个字符串还必须出现在here document的末尾。下面是一个例子，在该例子中，我们对多个文件进行重命名，并且使用here documents打印帮助：
#!/bin/sh
# we have less than 3 arguments. Print the help text:
if [ $# -lt 3 ] ; then
cat <<HELP
ren -- renames a number of files using sed regular expressions
USAGE: ren 'regexp' 'replacement' files...
EXAMPLE: rename all *.HTM files in *.html:
ren 'HTM$' 'html' *.HTM
HELP
exit 0
fi
OLD="$1"
NEW="$2"
# The shift command removes one argument from the list of
# command line arguments.
shift
shift
# $* contains now all the files:
for file in $*; do
if [ -f "$file" ] ; then
newfile=`echo "$file" | sed "s/${OLD}/${NEW}/g"`
if [ -f "$newfile" ]; then
echo "ERROR: $newfile exists already"
else
echo "renaming $file to $newfile ..."
mv "$file" "$newfile"
fi
fi
done
这是一个复杂一些的例子。让我们详细讨论一下。第一个if表达式判断输入命令行参数是否小于3个 (特殊变量$# 表示包含参数的个数) 。如果输入参数小于3个，则将帮助文字传递给cat命令，然后由cat命令将其打印在屏幕上。打印帮助文字后程序退出。 如果输入参数等于或大于3个，我们就将第一个参数赋值给变量OLD，第二个参数赋值给变量NEW。下一步，我们使用shift命令将第一个和第二个参数从参数列表中删除，这样原来的第三个参数就成为参数列表$*的第一个参数。然后我们开始循环，命令行参数列表被一个接一个地被赋值给变量$file。接着我们判断该文件是否存在，如果存在则通过sed命令搜索和替换来产生新的文件名。然后将反短斜线内命令结果赋值给newfile。这样我们就达到了我们的目的：得到了旧文件名和新文件名。然后使用mv命令进行重命名。
函数
如果您写了一些稍微复杂一些的程序，您就会发现在程序中可能在几个地方使用了相同的代码，并且您也会发现，如果我们使用了函数，会方便很多。一个函数是这个样子的：
functionname()
{
# inside the body $1 is the first argument given to the function
# $2 the second ...
body
}
您需要在每个程序的开始对函数进行声明。
下面是一个叫做xtitlebar的脚本，使用这个脚本您可以改变终端窗口的名称。这里使用了一个叫做help的函数。正如您可以看到的那样，这个定义的函数被使用了两次。
#!/bin/sh
# vim: set sw=4 ts=4 et:
help()
{
cat <<HELP
xtitlebar -- change the name of an xterm, gnome-terminal or kde konsole
USAGE: xtitlebar [-h] "string_for_titelbar"
OPTIONS: -h help text
EXAMPLE: xtitlebar "cvs"
HELP
exit 0
}
# in case of error or if -h is given we call the function help:
[ -z "$1" ] && help
[ "$1" = "-h" ] && help
# send the escape sequence to change the xterm titelbar:
echo -e "33]0;$107"
#
在脚本中提供帮助是一种很好的编程习惯，这样方便其他用户（和您）使用和理解脚本。
命令行参数
我们已经见过$* 和 $1, $2 ... $9 等特殊变量，这些特殊变量包含了用户从命令行输入的参数。迄今为止，我们仅仅了解了一些简单的命令行语法（比如一些强制性的参数和查看帮助的-h选项）。但是在编写更复杂的程序时，您可能会发现您需要更多的自定义的选项。通常的惯例是在所有可选的参数之前加一个减号，后面再加上参数值 (比如文件名)。
有好多方法可以实现对输入参数的分析，但是下面的使用case表达式的例子无遗是一个不错的方法。
#!/bin/sh
help()
{
cat <<HELP
This is a generic command line parser demo.
USAGE EXAMPLE: cmdparser -l hello -f -- -somefile1 somefile2
HELP
exit 0
}
while [ -n "$1" ]; do
case $1 in
-h) help;shift 1;; # function help is called
-f) opt_f=1;shift 1;; # variable opt_f is set
-l) opt_l=$2;shift 2;; # -l takes an argument -> shift by 2
--) shift;break;; # end of options
-*) echo "error: no such option $1. -h for help";exit 1;;
*) break;;
esac
done
echo "opt_f is $opt_f"
echo "opt_l is $opt_l"
echo "first arg is $1"
echo "2nd arg is $2"
您可以这样运行该脚本：
cmdparser -l hello -f -- -somefile1 somefile2
返回的结果是：
opt_f is 1
opt_l is hello
first arg is -somefile1
2nd arg is somefile2
这个脚本是如何工作的呢？脚本首先在所有输入命令行参数中进行循环，将输入参数与case表达式进行比较，如果匹配则设置一个变量并且移除该参数。根据unix系统的惯例，首先输入的应该是包含减号的参数。
实例
一般编程步骤
现在我们来讨论编写一个脚本的一般步骤。任何优秀的脚本都应该具有帮助和输入参数。并且写一个伪脚本（framework.sh），该脚本包含了大多数脚本都需要的框架结构，是一个非常不错的主意。这时候，在写一个新的脚本时我们只需要执行一下命令：
cp framework.sh myscript
然后再插入自己的函数。
让我们再看两个例子：
二进制到十进制的转换
脚本 b2d 将二进制数 (比如 1101) 转换为相应的十进制数。这也是一个用expr命令进行数学运算的例子：
#!/bin/sh
# vim: set sw=4 ts=4 et:
help()
{
cat <<HELP
b2h -- convert binary to decimal
USAGE: b2h [-h] binarynum
OPTIONS: -h help text
EXAMPLE: b2h 111010
will return 58
HELP
exit 0
}
error()
{
# print an error and exit
echo "$1"
exit 1
}
lastchar()
{
# return the last character of a string in $rval
if [ -z "$1" ]; then
# empty string
rval=""
return
fi
# wc puts some space behind the output this is why we need sed:
numofchar=`echo -n "$1" | wc -c | sed 's/ //g' `
# now cut out the last char
rval=`echo -n "$1" | cut -b $numofchar`
}
chop()
{
# remove the last character in string and return it in $rval
if [ -z "$1" ]; then
# empty string
rval=""
return
fi
# wc puts some space behind the output this is why we need sed:
numofchar=`echo -n "$1" | wc -c | sed 's/ //g' `
if [ "$numofchar" = "1" ]; then
# only one char in string
rval=""
return
fi
numofcharminus1=`expr $numofchar "-" 1`
# now cut all but the last char:
rval=`echo -n "$1" | cut -b 0-${numofcharminus1}`
}
while [ -n "$1" ]; do
case $1 in
-h) help;shift 1;; # function help is called
--) shift;break;; # end of options
-*) error "error: no such option $1. -h for help";;
*) break;;
esac
done
# The main program
sum=0
weight=1
# one arg must be given:
[ -z "$1" ] && help
binnum="$1"
binnumorig="$1"
while [ -n "$binnum" ]; do
lastchar "$binnum"
if [ "$rval" = "1" ]; then
sum=`expr "$weight" "+" "$sum"`
fi
# remove the last position in $binnum
chop "$binnum"
binnum="$rval"
weight=`expr "$weight" "*" 2`
done
echo "binary $binnumorig is decimal $sum"
#
该脚本使用的算法是利用十进制和二进制数权值 (1,2,4,8,16,..)，比如二进制"10"可以这样转换成十进制：
0 * 1 + 1 * 2 = 2
为了得到单个的二进制数我们是用了lastchar 函数。该函数使用wc –c计算字符个数，然后使用cut命令取出末尾一个字符。Chop函数的功能则是移除最后一个字符。
文件循环程序
或许您是想将所有发出的邮件保存到一个文件中的人们中的一员，但是在过了几个月以后，这个文件可能会变得很大以至于使对该文件的访问速度变慢。下面的脚本rotatefile 可以解决这个问题。这个脚本可以重命名邮件保存文件（假设为outmail）为outmail.1，而对于outmail.1就变成了outmail.2 等等等等...
#!/bin/sh
# vim: set sw=4 ts=4 et:
ver="0.1"
help()
{
cat <<HELP
rotatefile -- rotate the file name
USAGE: rotatefile [-h] filename
OPTIONS: -h help text
EXAMPLE: rotatefile out
This will e.g rename out.2 to out.3, out.1 to out.2, out to out.1
and create an empty out-file
The max number is 10
version $ver
HELP
exit 0
}
error()
{
echo "$1"
exit 1
}
while [ -n "$1" ]; do
case $1 in
-h) help;shift 1;;
--) break;;
-*) echo "error: no such option $1. -h for help";exit 1;;
*) break;;
esac
done
# input check:
if [ -z "$1" ] ; then
error "ERROR: you must specify a file, use -h for help"
fi
filen="$1"
# rename any .1 , .2 etc file:
for n in 9 8 7 6 5 4 3 2 1; do
if [ -f "$filen.$n" ]; then
p=`expr $n + 1`
echo "mv $filen.$n $filen.$p"
mv $filen.$n $filen.$p
fi
done
# rename the original file:
if [ -f "$filen" ]; then
echo "mv $filen $filen.1"
mv $filen $filen.1
fi
echo touch $filen
touch $filen
这个脚本是如何工作的呢？在检测用户提供了一个文件名以后，我们进行一个9到1的循环。文件9被命名为10，文件8重命名为9等等。循环完成之后，我们将原始文件命名为文件1同时建立一个与原始文件同名的空文件。
调试
最简单的调试命令当然是使用echo命令。您可以使用echo在任何怀疑出错的地方打印任何变量值。这也是绝大多数的shell程序员要花费80%的时间来调试程序的原因。Shell程序的好处在于不需要重新编译，插入一个echo命令也不需要多少时间。
shell也有一个真实的调试模式。如果在脚本"strangescript" 中有错误，您可以这样来进行调试：
sh -x strangescript
这将执行该脚本并显示所有变量的值。
shell还有一个不需要执行脚本只是检查语法的模式。可以这样使用：
sh -n your_script
这将返回所有语法错误。
‘伍’ 编写Shell脚本---接受、判断用户参数
[TOC]
如果想查看当前所在工作路径并列出当前目录下所有的文件及属性信指派粗息，实现这个功能的脚本如下：
Shell脚本文件的名称可以任意，但为了避免被误以为是普通文件，建议将 .sh 后缀加上，以表示是一个脚本文件
在上面的 example.sh 脚本中出现了三种不同的元素：
执行脚本有两种方式：
各变量的作用：
用测试语句测试一个文件是否为目录,然后通过 Shell 解释器内设 $? 变量显示上一条命令的返回值
在Shell终端中逻辑“与”的运算符号是 && ，它表示当前面的命令执行成功后才执行后面的命令
等号两边必须要有空格，才能进行逻辑等于
它表示把条件测试中的判断结果取相反值
整数比较运算符仅对数字操作，且不能使用等号、大于号、小于号来判断。因为等号与赋值唯镇命令符冲突，大于号和小于号分别与输出重定向和输入重定向命令符冲突。因此一定要使用规范的整数比较运算羡李符进行操作。
示例：使用 free -m 命令查看内存使用量情况（单位MB），然后通过 grep Mem: 命令过滤出剩余内存量的行，使用 awk'{print $4}' 命令只保留第四列，最后用 FreeMem=`语句` 的方式把语句内执行结果复制给变量
示例1 ：判断String变量是否为空，进而判断是否定义了这个变量
示例2 ：引入逻辑运算符，判断语系LANG
‘陆’ 如何编写一个shell脚本
新建一个文件shell脚本一般用×.sh作为后缀当然勇气他的也可以。打开终端输入touch first.sh 新建一个名为first的shell脚本。
编写一个简单的linuxshell脚本
使用vim 编辑first.sh也可以用其他的文本编辑器，推荐使用vim
使用命令 vim first.sh打开，输入i进入编辑模式。
编写一个简单的linuxshell脚本
我们写入一个简单的shell脚本，注意第一行的代码解释器的指定，这里使用的是/bin/bash/ 解释器 也可用其他的根据个人情况自己选择。
脚本解释：
echo //显示一串字符并自动换行
read NAME //从屏幕获取一段字符，并赋予NAME
$NAME //取NAME变量的值
# //只用一个#表示注释文本
编写一个简单的linuxshell脚本
文件写完后按下esc键 退出插入模式，接着输入：wq 保存文本并退出文本编辑。
编写一个简单的linuxshell脚本
输入sh + 脚本名称 运行脚本，或给文件可运行权限 chmod +x 然后输入./first.sh运行脚本。
‘柒’ 学生信的那些事儿之七 - Linux基础之Shell脚本编程
沿着前面的轨迹，接下来是Linux中shell脚本的学习。这对于生信工程师后续处理大量 (海量更合适些) 数据是非常非常重要的，但是同样的，作为一个有点古板的人，对于"脚本"是什么意思我都死磕了好久。主要觉得有些抽象，尤其是跟生信的同事讨论项目分析部分的问题时，他们经常会说道这个词，在他们意识里这是个不言自明的术语，殊不知对外行人而言 (比如我)，那简直就是无情的"知识的诅咒"。经常是我假装听懂了，然后继续讨论下面的问题，形成一个模糊的印象。
网络上的解释是：脚本（Script）是一种批处理文件的延伸，是一种纯文本保存的程序，一般来说的计算机脚本程序是确定的一系列控制计算机进行运算操作动作的组合，在其中可以实现一定的逻辑分支等。不知道你能不能看懂，反正我开始的时候真是一知半解。
鸟哥私房菜的解释是：shell script是利用 shell 的功能所写的一个"程序"，这个程序是使用纯文本文件，将一些shell的语法与命令(含外部命令)写在里面，搭配正则表达式、管道命令与数据流重定向等功能，以达到我们所想要的处理的目的。不明觉厉，好像更看不懂了···
Jude 的简单粗暴大白话解释是：脚本就是Linux中很多命令按照一定规则的组合，以实现某个特定的功能。Linux中有很多简单的命令，往往只是进行了简单的对话，比如 cd 就是进入到某个目录，简单直接。但是如果我想进入某个目录A，然后在目录A中创建目录B，再在目录B中创建文本C呢？当然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢，那就可以用脚本，把三个命令写在一起，一起执行。好像有点啰嗦···
或者从英语的角度去理解，脚本的对应英文是Script，而这个单词的中文释义中还有剧本的意思。剧本就好理解了啊，剧本就是导演(生信工程师)基于某个主旨(要实现的目标)按照一定的手法(规则)所写的一个故事。不管是哪个演员，都得按照剧本演。所以，学好英语对于生信也是有帮助的~
按照脚本的复杂程度可以分为：
这个无需多说，其实就是若干个简单命令的顺序排列，执行脚本后会按照命令的前后关系从前往后一一执行。
相对于简单的基本脚本，结构化的命令脚本可以施加逻辑流程控制，从而改变程序(命令)执行的顺序。基本脚本中的命令就是从上往下执行，但是结构化的命令脚本可以根据逻辑判断重复或者跳过某些命令。
常用的结构化命令(语句)有：
后面还有什么嵌套循环啊啥的，不过我觉得上面的7中命令学到家了，应该可以应付大部分在生信分析里面的应用了。
记得高中的时候，物理老师(也是班主任)在给我们讲解习题时有个有意思的套路：不管什么难题现在下面写个"答："，以示自己解决问题的决心，也是一种正向的心理暗示。脚本编写也是有套路的，不过总的来说还是比较简单。
对于简单的脚本(超级简单的那种)，直接几个命令连在一起即可，中间用"；"隔开。
对于更长更复杂的脚本，一般需要创建一个文本，并在里面编辑。这就涉及到了文本编辑器，比较常用和简单的一般有nano和vim，实在很简单，规则也容易理解，教程随手可得，不多说。
比如用vim创建了一个脚本之后，具体的语法(套路)：
ok，脚本写完了，怎么让脚本开始工作呢？这有涉及到之前讲过的环境变量和相对路径、绝对路径了。方法有三：
就这么多吧，应该有点感觉到了，剩下的就是狂练狂练了~